206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03709 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03709  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  545  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3953  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  74.19 
 
 		 275 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.568339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4066  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  74.19 
 
 		 275 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3477  Siderophore-interacting protein  33.84 
 
 		 289 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06780  siderophore-interacting protein  33.7 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0387  Siderophore-interacting protein  34.73 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5976  iron transport/utilisation related protein  35.27 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4296  Siderophore-interacting protein  35.25 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000530029 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2693  Siderophore-interacting protein  36.88 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25640  siderophore-interacting protein  35.32 
 
 		 274 aa  125  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.819064  normal  0.256648 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4199  FAD-binding 9, siderophore-interacting protein  33.96 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1323  Siderophore-interacting protein  35.06 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1856  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.55 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0769877  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3804  siderophore-interacting protein  33.59 
 
 		 277 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48919  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0634  FAD-binding 9, siderophore-interacting  32.27 
 
 		 274 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4106  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.42 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375544  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0912  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.71 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4272  siderophore-interacting protein  32.83 
 
 		 281 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0096  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  33.86 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0363  Siderophore-interacting protein  30.71 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3586  Siderophore-interacting protein  33.71 
 
 		 279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0023  siderophore-interacting protein  30.89 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0888  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  33.2 
 
 		 279 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0021  siderophore-interacting protein  31.88 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1528  siderophore-interacting protein  31.88 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1159  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  31.89 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1086  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  34.92 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1173  siderophore-interacting protein  31.88 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1453  siderophore-interacting protein  31.88 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0029  siderophore-interacting protein  31.88 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000742042  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0027  siderophore-interacting protein  31.88 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0026  siderophore-interacting protein  31.88 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3427  siderophore-interacting protein  32.43 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0328876  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1056  iron-chelator utilization protein, putative  34.52 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  32.68 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2101  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  36.82 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41911  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4373  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  31.01 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0726253  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4356  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  34.52 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  34.13 
 
 		 253 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1968  siderophore-interacting protein  33.7 
 
 		 285 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1126  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.31 
 
 		 271 aa  105  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.382701 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1988  FAD-binding 9, siderophore-interacting  33.82 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0091  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  32.68 
 
 		 250 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2034  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  33.82 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870658  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4193  iron utilization protein, putative  29.62 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06920  hypothetical protein  29.8 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000911  utilization protein for catechol-siderophore  29.17 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2205  siderophore-interacting protein  31.73 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2309  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2442  Siderophore-interacting protein  31.09 
 
 		 267 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.402244  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2021  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  31.5 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3043  siderophore-interacting protein  30.23 
 
 		 623 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03816  putative siderophore utilization protein  28.78 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.25 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0096  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  31.08 
 
 		 247 aa  99.4  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3927  siderophore-interacting protein  29.23 
 
 		 255 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4573  siderophore-interacting protein  30.51 
 
 		 261 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2699  siderophore-interacting protein  31.58 
 
 		 304 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.295882  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2184  siderophore-interacting protein  25.77 
 
 		 246 aa  99.4  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249595  normal  0.170908 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1091  putative iron transport/utilisation related protein  31.23 
 
 		 275 aa  99  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0143564 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2126  FAD-binding 9, siderophore-interacting  27.97 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00704936  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0094  siderophore-interacting protein  30.68 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0099  siderophore-interacting protein  31.08 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0918  Siderophore-interacting protein  35.05 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2810  FAD-binding 9, siderophore-interacting  34.98 
 
 		 348 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.445177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17630  siderophore-interacting protein  32.22 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.868687  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0076  siderophore-interacting protein  30.68 
 
 		 251 aa  97.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1860  iron-chelator utilization protein  31.87 
 
 		 273 aa  96.7  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1452  Siderophore-interacting protein  33.86 
 
 		 275 aa  96.3  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.100932  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2448  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  33.72 
 
 		 256 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5308  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  29.73 
 
 		 270 aa  95.9  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4986  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  29.12 
 
 		 273 aa  95.9  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2259  FAD-binding 9, siderophore-interacting  29.18 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2366  Siderophore-interacting protein  32.12 
 
 		 258 aa  95.1  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.277442  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0535  Siderophore-interacting protein  31.46 
 
 		 617 aa  94.4  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.911825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0773  siderophore-interacting protein  30.92 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.71701  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4255  siderophore-interacting protein  30.68 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3016  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  31.33 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3687  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.26 
 
 		 289 aa  94.7  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443256  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0833  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.69 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3731  Siderophore-interacting protein  31.14 
 
 		 356 aa  94  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3163  siderophore-interacting protein  28.46 
 
 		 273 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3395  vibriobactin utilization protein ViuB  30.94 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.472238 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1802  vibriobactin utilization protein ViuB  28.4 
 
 		 271 aa  93.6  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3789  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  30.56 
 
 		 322 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5142  FAD-binding 9, siderophore-interacting  27.66 
 
 		 273 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5717  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  27.66 
 
 		 273 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4137  siderophore-interacting protein  29.52 
 
 		 281 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1787  Siderophore-interacting protein  32.37 
 
 		 325 aa  92.8  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00316265  normal  0.123717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0871  siderophore-interacting protein  27.8 
 
 		 247 aa  92.4  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314795  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3561  Siderophore-interacting protein  32.84 
 
 		 283 aa  92.4  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5136  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  29.04 
 
 		 278 aa  92.4  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.509715  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1592  Siderophore-interacting protein  30 
 
 		 259 aa  92  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0997  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  31.14 
 
 		 210 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000118529 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4522  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  28.07 
 
 		 273 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2566  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  31.17 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.108893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3931  siderophore-interacting protein  29.73 
 
 		 346 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4221  Siderophore-interacting protein  31.43 
 
 		 242 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186692  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2762  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  29.05 
 
 		 299 aa  89.7  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3865  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  29.15 
 
 		 311 aa  89  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0336  siderophore-interacting protein  32 
 
 		 361 aa  89  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>