45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3359 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3359  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  394  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.363359  normal  0.0103184 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2031  hypothetical protein  86.21 
 
 		 174 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2731  hypothetical protein  71.82 
 
 		 202 aa  251  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4013  protein of unknown function DUF1321  73.33 
 
 		 178 aa  251  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3270  hypothetical protein  73.56 
 
 		 172 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.128357  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6105  hypothetical protein  74.29 
 
 		 175 aa  246  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2352  hypothetical protein  68.13 
 
 		 182 aa  241  7e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1418  hypothetical protein  56.28 
 
 		 198 aa  210  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1361  hypothetical protein  52.88 
 
 		 189 aa  192  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.151036  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1404  hypothetical protein  52.36 
 
 		 189 aa  190  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2889  protein of unknown function DUF1321  48.15 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547275  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0771  hypothetical protein  53.55 
 
 		 184 aa  184  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4523  hypothetical protein  49.76 
 
 		 208 aa  184  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.887318  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2784  protein of unknown function DUF1321  47.49 
 
 		 220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.297905  normal  0.184537 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2027  hypothetical protein  52.54 
 
 		 171 aa  182  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0688621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1982  hypothetical protein  50.85 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0705433  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2824  hypothetical protein  55.68 
 
 		 169 aa  179  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.000998025  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1773  hypothetical protein  47.5 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.424337  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0697  protein of unknown function DUF1321  46.19 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0730761  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2662  hypothetical protein  47.22 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.950467  normal  0.462988 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0599  protein of unknown function DUF1321  53.07 
 
 		 180 aa  176  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0962477 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2544  protein of unknown function DUF1321  50.84 
 
 		 171 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0507357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2803  protein of unknown function DUF1321  50.28 
 
 		 171 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.924782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1093  hypothetical protein  52.41 
 
 		 208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2446  hypothetical protein  51.72 
 
 		 160 aa  172  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357149 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0930  hypothetical protein  44.51 
 
 		 177 aa  148  4e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.247619  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2041  hypothetical protein  57.14 
 
 		 165 aa  144  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1450  hypothetical protein  45.24 
 
 		 159 aa  137  8.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3150  hypothetical protein  49.63 
 
 		 160 aa  137  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3359  hypothetical protein  43.6 
 
 		 161 aa  134  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0703032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2205  hypothetical protein  44.63 
 
 		 196 aa  132  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00100691  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1005  hypothetical protein  55.75 
 
 		 166 aa  130  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2716  hypothetical protein  42.69 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2333  hypothetical protein  45.4 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0025839  normal  0.298167 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0722  hypothetical protein  43.45 
 
 		 153 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0813  hypothetical protein  50.91 
 
 		 152 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2139  hypothetical protein  50.91 
 
 		 152 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1336  hypothetical protein  51.82 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1909  hypothetical protein  39.88 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.195095 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2391  hypothetical protein  50.88 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.161078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1150  protein of unknown function DUF1321  47.46 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0462  hypothetical protein  40.8 
 
 		 166 aa  91.3  8e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0128  hypothetical protein  42 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.547253  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0325  hypothetical protein  37.84 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  unclonable  0.000000000262702  n/a   
 
 
 
NC_007799  ECH_0744  hypothetical protein  39.17 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.00000544943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>