24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0948 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0839  hypothetical protein  81.36 
 
 		 397 aa  662    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0948  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  789    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5213  hypothetical protein  73.8 
 
 		 397 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4862  hypothetical protein  68.01 
 
 		 395 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0687822  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0672  hypothetical protein  62.25 
 
 		 396 aa  496  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.745104  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0581  hypothetical protein  60.46 
 
 		 414 aa  483  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1181  hypothetical protein  62.16 
 
 		 394 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0016  hypothetical protein  28.75 
 
 		 354 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.142957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3249  hypothetical protein  33.56 
 
 		 365 aa  133  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.106475 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4444  hypothetical protein  29.58 
 
 		 374 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2441  hypothetical protein  31.21 
 
 		 368 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1649  conserved hypothetical proteinn  31.74 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1869  hypothetical protein  27.95 
 
 		 367 aa  119  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274473  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1590  hypothetical protein  27.88 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  0.0229246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2548  hypothetical protein  25.93 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3536  hypothetical protein  27.14 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0317173 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3559  hypothetical protein  25.64 
 
 		 343 aa  75.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3224  hypothetical protein  25.98 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3577  hypothetical protein  24.22 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0395057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3870  hypothetical protein  26.09 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2378  hypothetical protein  23.75 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268153 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0991  hypothetical protein  28.17 
 
 		 339 aa  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2943  hypothetical protein  24.14 
 
 		 332 aa  46.2  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0604603 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1585  hypothetical protein  22.36 
 
 		 366 aa  43.1  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>