198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0261 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0261  creatininase  100 
 
 		 270 aa  534  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0569  creatininase  89.96 
 
 		 270 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0472  Creatininase  80.6 
 
 		 270 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0569  creatininase  72.66 
 
 		 271 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0424  creatininase  69.52 
 
 		 272 aa  382  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0330  creatininase  70.15 
 
 		 272 aa  378  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.128511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7483  hypothetical protein  68.28 
 
 		 275 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.039652  normal  0.0970376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4493  Creatininase  61.63 
 
 		 267 aa  300  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.930065  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0883  creatininase  62.2 
 
 		 262 aa  299  4e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0858685  hitchhiker  0.00255114 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1161  Creatininase  53.21 
 
 		 268 aa  290  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0886457 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2410  Creatininase  58.53 
 
 		 258 aa  289  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.164045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2133  creatininase  58.14 
 
 		 258 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.217786 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4561  creatininase  61.39 
 
 		 267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  decreased coverage  0.00113285 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2093  Creatininase  57.75 
 
 		 258 aa  270  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2638  creatininase  53.75 
 
 		 285 aa  265  5e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1083  creatininase  50.19 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.115245  normal  0.518041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1680  Creatininase  45.95 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4661  Creatininase  45.25 
 
 		 288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0928  putative creatinine amidohydrolase  49.38 
 
 		 256 aa  233  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119033  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5132  Creatininase  46.04 
 
 		 273 aa  232  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0986  creatinine amidohydrolase, putative  49.38 
 
 		 256 aa  232  5e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3147  creatininase  47.17 
 
 		 272 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3547  creatinine amidohydrolase  45.08 
 
 		 266 aa  229  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3869  creatininase  43.51 
 
 		 266 aa  225  6e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3681  Creatininase  45.91 
 
 		 262 aa  225  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1271  hypothetical protein  46.9 
 
 		 270 aa  221  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3794  creatinine amidohydrolase  43.75 
 
 		 273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2844  creatininase  47.95 
 
 		 246 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4444  creatininase  47.11 
 
 		 282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1374  creatininase  49.79 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4255  creatininase  44.15 
 
 		 282 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2031  Creatininase  45.35 
 
 		 272 aa  209  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  0.925185 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0394  creatininase  44.03 
 
 		 289 aa  208  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1376  creatininase  44.96 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5280  creatinine amidohydrolase  41.38 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1102  Creatininase  47.92 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2766  creatininase  45.31 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1712  creatininase  44.7 
 
 		 273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.89786 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3746  creatininase  44.04 
 
 		 286 aa  199  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3383  Creatininase  47.11 
 
 		 262 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.81678  normal  0.197004 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0737  Creatininase  46.44 
 
 		 275 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1478  creatininase  43.41 
 
 		 261 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1108  creatininase  38.59 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1171  creatininase  42.02 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.292018  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2461  Creatininase  44.11 
 
 		 275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.751593  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3125  Creatininase  43.51 
 
 		 275 aa  183  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0368  creatininase  45.08 
 
 		 282 aa  182  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3852  creatininase  43.13 
 
 		 289 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0589  creatininase  42.34 
 
 		 287 aa  179  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3053  creatininase  41.9 
 
 		 263 aa  171  9e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1081  Creatininase  42.13 
 
 		 267 aa  168  8e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4012  creatininase  36.68 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.959874 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4095  Creatininase  34.11 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4134  Creatininase  34.11 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.36318 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1506  Creatininase  34.11 
 
 		 270 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000254025 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0727  creatininase  39.61 
 
 		 280 aa  149  4e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0217  creatininase  34.5 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.240756  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05871  creatininase  34.54 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07781  creatininase  39.09 
 
 		 273 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1862  creatininase  34.14 
 
 		 265 aa  145  9e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.168634  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1636  creatininase  40.93 
 
 		 284 aa  142  9e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.136461  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4757  Creatininase  40.54 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05341  creatininase  36.02 
 
 		 301 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.662589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05951  creatininase  32.91 
 
 		 262 aa  138  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1592  creatinine amidohydrolase  35.85 
 
 		 271 aa  138  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.306443 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05871  creatininase  31.35 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.294847  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05571  creatininase  31.01 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0531  creatininase  32.49 
 
 		 262 aa  132  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3867  Creatininase  34.8 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.067278  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1248  Creatininase  35.8 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536896  normal  0.253554 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0580  Creatininase  34.26 
 
 		 237 aa  108  9.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3150  creatininase  37.05 
 
 		 252 aa  106  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0910  Creatininase  31.13 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1831  Creatininase  32.34 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17310  uncharacterized protein, putative amidase  31.5 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00237656  normal  0.0796257 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3192  Creatininase  28.26 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2244  Creatininase  31.2 
 
 		 245 aa  99.4  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1389  Creatininase  30.74 
 
 		 257 aa  98.6  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.569079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8302  Creatininase  33.76 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0997  creatininase  31.18 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0796188 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0080  Creatininase  30.53 
 
 		 249 aa  96.7  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2403  Creatininase  30.45 
 
 		 245 aa  96.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2940  Creatininase  33.47 
 
 		 259 aa  95.5  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1638  creatininase  31.28 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3103  Creatininase  29.96 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0769  Creatininase  32.8 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1406  creatininase  29.91 
 
 		 226 aa  93.6  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.708048  hitchhiker  0.000645315 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4704  Creatininase  31.9 
 
 		 245 aa  93.6  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.102528  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2360  Creatininase  36.12 
 
 		 237 aa  93.2  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221441  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2211  Creatininase  38.04 
 
 		 256 aa  92  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10709  hypothetical protein  34.51 
 
 		 251 aa  92  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693631 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1412  Creatininase  29.24 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0974833  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0439  Creatininase  31.8 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0649  Creatininase  30.73 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4022  Creatininase  37.81 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0548  Creatininase  29.46 
 
 		 260 aa  90.5  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.105845  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4930  Creatininase  35.22 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0306172  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3774  Creatininase  35.81 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1799  creatininase  35.26 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0793  Creatininase  31.58 
 
 		 265 aa  89.7  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.847231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>