12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3331 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3331  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.400491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2390  hypothetical protein  75.46 
 
 		 277 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.325647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3061  hypothetical protein  72.93 
 
 		 275 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3562  hypothetical protein  69.4 
 
 		 275 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.252373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4780  hypothetical protein  73.91 
 
 		 295 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1669  hypothetical protein  63.16 
 
 		 281 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3795  hypothetical protein  63.92 
 
 		 277 aa  344  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.394583 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4040  hypothetical protein  61.42 
 
 		 277 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1229  hypothetical protein  63.95 
 
 		 275 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2916  putative hydrolase  56.98 
 
 		 277 aa  326  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0078  hypothetical protein  43.75 
 
 		 526 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0137812  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1120  hypothetical protein  38.14 
 
 		 281 aa  125  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.381858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>