35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2530 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2530  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  176  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.234183 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0298  pentapeptide MXKDX repeat protein  66.3 
 
 		 109 aa  88.2  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0310  pentapeptide MXKDX repeat protein  65.22 
 
 		 109 aa  86.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2814  pentapeptide MXKDX repeat protein  62.67 
 
 		 79 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.873208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4053  hypothetical protein  58.14 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2593  hypothetical protein  53.68 
 
 		 93 aa  70.1  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3133  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  59.21 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal  0.206734 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2731  hypothetical protein  53.26 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2570  pentapeptide MXKDX repeat protein  57.14 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2991  pentapeptide MXKDX repeat protein  67.21 
 
 		 83 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272043  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0540  hypothetical protein  47.83 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1511  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  48.51 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.144611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0483  hypothetical protein  55.67 
 
 		 101 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1402  hypothetical protein  55.67 
 
 		 101 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.386495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1397  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  55.67 
 
 		 101 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1198  hypothetical protein  55.67 
 
 		 101 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0725407  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0669  hypothetical protein  55.67 
 
 		 101 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.664868  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2179  hypothetical protein  56.76 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.565445 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1530  hypothetical protein  55.67 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1698  pentapeptide MXKDX repeat protein  43.82 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2752  pentapeptide MXKDX repeat protein  41.76 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1517  hypothetical protein  43.53 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2931  hypothetical protein  53.61 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2843  hypothetical protein  50.6 
 
 		 169 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4332  hypothetical protein  50.62 
 
 		 91 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.834965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2538  hypothetical protein  68.09 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0621  hypothetical protein  47.5 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1196  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  52.27 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0762518  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2665  pentapeptide MXKDX repeat protein  65.22 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0017  hypothetical protein  47.69 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0020  hypothetical protein  48.48 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4814  pentapeptide MXKDX repeat protein  45.35 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.901496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5021  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  44.87 
 
 		 77 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978776  normal  0.0965687 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4104  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  39.13 
 
 		 92 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0198  hypothetical protein  51.92 
 
 		 166 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>