More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2242 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  100 
 
 		 202 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  63.83 
 
 		 203 aa  235  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2310  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  64.36 
 
 		 203 aa  234  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0314932  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  63.83 
 
 		 203 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0447  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  56.86 
 
 		 204 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  54.95 
 
 		 201 aa  208  4e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.226705  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  56.22 
 
 		 201 aa  204  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  56.22 
 
 		 201 aa  204  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1240  acyl-carrier-protein phosphodiesterase  54.11 
 
 		 206 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4165  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  54.23 
 
 		 182 aa  200  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.85 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.85 
 
 		 202 aa  199  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222765 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  54.59 
 
 		 201 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2663  NADH-azoreductase, FMN-dependent  52.97 
 
 		 201 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6637  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.94 
 
 		 205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6485  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  55.68 
 
 		 201 aa  187  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2533  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.55 
 
 		 195 aa  187  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4469  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  53.59 
 
 		 204 aa  185  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2282  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50.81 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142259 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.21 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01081  acyl carrier protein phosphodiesterase  50 
 
 		 198 aa  174  7e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000183186  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06238  acyl carrier protein phosphodiesterase  50 
 
 		 198 aa  174  7e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.544939  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  50.79 
 
 		 203 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  52.66 
 
 		 202 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  51.38 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2752  azoreductase  49.74 
 
 		 203 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  50.26 
 
 		 203 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  43.72 
 
 		 203 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  49.21 
 
 		 203 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  45.77 
 
 		 214 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  45.77 
 
 		 214 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3003  azoreductase  46.39 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3136  acyl carrier protein phosphodiesterase  45 
 
 		 202 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00683712  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  49.44 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1775  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  46.23 
 
 		 197 aa  165  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  45.5 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  49.47 
 
 		 202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.56 
 
 		 208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.56 
 
 		 208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  45.5 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  47.78 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.11 
 
 		 215 aa  161  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  46.39 
 
 		 213 aa  160  9e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1441  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  46.08 
 
 		 206 aa  158  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1590  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.86 
 
 		 207 aa  157  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00209131  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  45.5 
 
 		 208 aa  157  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0387  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  42.36 
 
 		 211 aa  157  9e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2002  azoreductase  50.27 
 
 		 202 aa  157  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0549421  hitchhiker  0.00845677 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6977  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.21 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.67 
 
 		 216 aa  155  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.4 
 
 		 207 aa  154  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0956  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.09 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  46.11 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.18 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2993  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.73 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.2 
 
 		 199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.2 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.2 
 
 		 199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3078  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  58.18 
 
 		 183 aa  137  8.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.88 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.3 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.8 
 
 		 199 aa  132  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.88 
 
 		 203 aa  131  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.635912  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  39.9 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  39.9 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  39.9 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  38.27 
 
 		 199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3529  azoreductase  38.42 
 
 		 197 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.56 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0320  azoreductase  38.12 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000159762  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2531  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.82 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  37.93 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  39.41 
 
 		 201 aa  126  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003549  FMN-dependent NADH-azoreductase  38.12 
 
 		 194 aa  125  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4396  azoreductase  36.5 
 
 		 198 aa  125  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  40.76 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1069  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.24 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0133696  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0325  azoreductase  37.62 
 
 		 198 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  40.76 
 
 		 201 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  40.76 
 
 		 201 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  40.76 
 
 		 201 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  40.76 
 
 		 201 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  39.41 
 
 		 201 aa  124  9e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0324  azoreductase  37.62 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00233774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  37.93 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0319  azoreductase  37.62 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000641081  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  36.45 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  37.93 
 
 		 201 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0423  azoreductase  37.62 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  37.93 
 
 		 201 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1692  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.19 
 
 		 200 aa  122  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3955  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.78 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0529615 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1488  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.13 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.385532 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3478  azoreductase  36.32 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0560  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  41.26 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.737585  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  36.27 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0316  azoreductase  36 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  38.38 
 
 		 213 aa  121  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  38.42 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>