32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0460 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0460  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  328  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0458  UspA  78.05 
 
 		 164 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0248  hypothetical protein  77.44 
 
 		 164 aa  259  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0015  hypothetical protein  75.61 
 
 		 164 aa  250  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0940017  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0008  hypothetical protein  73.78 
 
 		 164 aa  249  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  0.18728 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0584  hypothetical protein  75 
 
 		 164 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.355702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0039  hypothetical protein  62.2 
 
 		 164 aa  209  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.389129 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0297  UspA domain-containing protein  53.37 
 
 		 168 aa  164  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.637126  normal  0.0141888 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4036  hypothetical protein  47.56 
 
 		 163 aa  141  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0141  hypothetical protein  47.56 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4427  UspA domain protein  49.38 
 
 		 167 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450533  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0035  UspA domain-containing protein  46.95 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329999  hitchhiker  0.0000151739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3395  UspA domain-containing protein  46.91 
 
 		 167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.251638 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3610  UspA domain-containing protein  47.24 
 
 		 168 aa  124  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0135  hypothetical protein  47.56 
 
 		 179 aa  124  8.000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0216796  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0429  Universal stress protein  45.73 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384598  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0037  UspA domain protein  46.95 
 
 		 163 aa  120  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.451642  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0154  UspA domain-containing protein  45.12 
 
 		 162 aa  120  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0025  UspA domain protein  46.95 
 
 		 163 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.83625  normal  0.406465 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3027  hypothetical protein  41.45 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0867  hypothetical protein  42 
 
 		 151 aa  107  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751448 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2278  UspA domain-containing protein  39.33 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377159  normal  0.574601 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0890  UspA domain-containing protein  38.67 
 
 		 151 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2501  hypothetical protein  37.11 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0532  UspA domain-containing protein  39.33 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.206586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2215  hypothetical protein  39.1 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2838  hypothetical protein  36.67 
 
 		 151 aa  94.4  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3730  hypothetical protein  38 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.808369 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3532  hypothetical protein  36.36 
 
 		 185 aa  86.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.053335  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1947  hypothetical protein  35.1 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.869369  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1368  UspA domain-containing protein  27.45 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131997  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1234  universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein  34.23 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>