17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3268 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3268  cytochrome C precursor  100 
 
 		 104 aa  214  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2197  cytochrome c, class I  76.7 
 
 		 104 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3207  putative cytochrome C precursor  63.11 
 
 		 104 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.681994 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2428  cytochrome c class I  67.31 
 
 		 104 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.49473  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  58.23 
 
 		 111 aa  98.6  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5816  cytochrome c-552 precursor  52.5 
 
 		 103 aa  90.1  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.591248  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3165  cytochrome c class I  39.8 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1637  cytochrome c class I  34.02 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0679  putative cytochrome c  36.26 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440902 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4698  putative cytochrome c552 precursor  33.33 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1579  hypothetical protein  31.91 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0348  putative cytochrome c precursor  30.1 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4640  putative cytochrome c552 precursor  31.31 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0768  putative cytochrome c552 precursor  32.91 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2628  putative cytochrome c552 precursor  30.77 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0849  putative cytochrome c precursor (cytochrome c552)(CycB)  31.25 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1273  cytochrome c class I  32.05 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>