14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4375 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4375  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 156 aa  306  9e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4835  hypothetical protein  75 
 
 		 157 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0575  hypothetical protein  47.68 
 
 		 156 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0639  peptidase A24A, prepilin type IV  51.28 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0614  peptidase A24A, prepilin type IV  47.68 
 
 		 156 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0179326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0620  peptidase A24A prepilin type IV  47.68 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0450509 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4589  peptidase A24A prepilin type IV  47.68 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0841  peptidase A24A prepilin type IV  44.37 
 
 		 146 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55800  hypothetical protein  31.97 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4862  hypothetical protein  36 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0540679  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1645  peptidase A24A, prepilin type IV  33.67 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000134327  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2165  peptidase A24A, prepilin type IV  39.78 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065681 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  43.75 
 
 		 194 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1735  peptidase A24A prepilin type IV  28.1 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000711664  hitchhiker  0.0000368667 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>