28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3493 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3493  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  635    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.3705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 		 1739 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0632  hypothetical protein  31.49 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1981  methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1977  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166112  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3663  hypothetical protein  27.86 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 251 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  43.48 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3685  hypothetical protein  29.9 
 
 		 194 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  27.37 
 
 		 265 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  26.9 
 
 		 255 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2737  hypothetical protein  22.94 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.447788  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  34.33 
 
 		 237 aa  46.6  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3600  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2734  hypothetical protein  32.98 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.93 
 
 		 764 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  37.7 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  42.55 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4962  Methyltransferase type 11  43.4 
 
 		 222 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  46.34 
 
 		 345 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 634 aa  43.5  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 241 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  40 
 
 		 277 aa  42.7  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3349  hypothetical protein  31.67 
 
 		 336 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487795  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1919  hypothetical protein  43.75 
 
 		 241 aa  42.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.596935  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3345  hypothetical protein  28.04 
 
 		 241 aa  42.7  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 216 aa  42.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>