17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2346 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2346  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  607  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3690  hypothetical protein  44.84 
 
 		 286 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.271759  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1585  putative EA31 gene protein, phage lambda  32.64 
 
 		 281 aa  132  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1568  hypothetical protein  24.29 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.445072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1203  hypothetical protein  26.7 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0444543  normal  0.100552 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4943  putative phage-related protein  37.7 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1003  hypothetical protein  34.34 
 
 		 175 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979437 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1736  hypothetical protein  24.32 
 
 		 233 aa  49.3  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.366884 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2728  hypothetical protein  32.93 
 
 		 361 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4237  hypothetical protein  28.86 
 
 		 356 aa  45.8  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5273  hypothetical protein  32.53 
 
 		 389 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2984  hypothetical protein  33.72 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2083  hypothetical protein  38.24 
 
 		 410 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000112256 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3989  HNH endonuclease  29.31 
 
 		 152 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.519886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3515  hypothetical protein  26.89 
 
 		 381 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0494  hypothetical protein  35.59 
 
 		 247 aa  42.7  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426631  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3009  hypothetical protein  29.93 
 
 		 409 aa  42.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>