51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2212 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2212  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 		 296 aa  593  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.276874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0540  arginase/agmatinase/formiminoglutamase family protein  50.17 
 
 		 298 aa  285  5.999999999999999e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0585  arginine deaminase  49.49 
 
 		 297 aa  285  8e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1242  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.25 
 
 		 288 aa  181  9.000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09260  arginase family hydrolase, arginase/agmainase/formiminoglutamate hydrolase  34.19 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1543  arginase  28.52 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427369  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4425  Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase arginase family-like protein  30.89 
 
 		 477 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5626  Arginase/agmatinase/formimino glutamase  28.8 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  decreased coverage  0.00341242 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  26.43 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  26.43 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  25.49 
 
 		 398 aa  54.7  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.11 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  27.74 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.63 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  22.74 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.11842 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1087  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.07 
 
 		 271 aa  49.3  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  29.3 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3076  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.76 
 
 		 367 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.504729 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  23.66 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  30.28 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  30.28 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  30.28 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  30.28 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  30.28 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  30.28 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  29.05 
 
 		 297 aa  47  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  30.28 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  26.51 
 
 		 304 aa  47  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  29.03 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  30.28 
 
 		 297 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  30.28 
 
 		 297 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  29.3 
 
 		 331 aa  45.8  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  26.09 
 
 		 305 aa  45.8  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  27.59 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2261  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  23.77 
 
 		 346 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  30.28 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  27.78 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  26.71 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  31.09 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  30 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  29.58 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2669  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.62 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0909707  normal  0.34784 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0221  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.28 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735889 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  27.59 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  25.64 
 
 		 326 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  25 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_003296  RS03092  hypothetical protein  79.17 
 
 		 47 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.882282  normal  0.316155 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  26.29 
 
 		 306 aa  42.7  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2793  agmatinase  24.47 
 
 		 280 aa  42.7  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  27.21 
 
 		 304 aa  42.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  27.39 
 
 		 298 aa  42.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>