16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1420 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1420  hypothetical protein  100 
 
 		 874 aa  1779    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2338  hypothetical protein  74.49 
 
 		 874 aa  1347    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000220057  unclonable  0.000000361106 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1272  hypothetical protein  74.83 
 
 		 874 aa  1352    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0450  SMC domain protein  57.75 
 
 		 877 aa  999    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.292453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5366  hypothetical protein  38.2 
 
 		 892 aa  519  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.0115994 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3707  SMC domain-containing protein  37.13 
 
 		 881 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1363  SMC protein-like  32.81 
 
 		 875 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.922778  normal  0.196985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3982  hypothetical protein  35.43 
 
 		 881 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0815711  hitchhiker  0.00348599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1830  hypothetical protein  27.47 
 
 		 955 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1103  SMC domain protein  33.8 
 
 		 808 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1085  DNA repair ATPase-like protein  33.82 
 
 		 741 aa  47.8  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0841172  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  38.6 
 
 		 634 aa  46.6  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  29.73 
 
 		 872 aa  45.8  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  31.82 
 
 		 874 aa  45.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2709  SMC domain protein  31.03 
 
 		 1036 aa  44.7  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0318  condensin subunit Smc  36.84 
 
 		 1307 aa  44.3  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>