More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_2130 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_2130  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 
410 aa  841    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.452189 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2454  aminotransferase, class I and II  90.73 
 
 
410 aa  769    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.658148  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2370  aminotransferase, class I and II  61.74 
 
 
409 aa  509  1e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0234318  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1195  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.5 
 
 
382 aa  347  2e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.760383 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0079  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.63 
 
 
394 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2457  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.47 
 
 
399 aa  319  6e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2189  8-amino-7-oxononanoate synthase  43 
 
 
388 aa  311  1e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1659  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.75 
 
 
380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0328  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.35 
 
 
380 aa  301  1e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.971003  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0351  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.1 
 
 
380 aa  300  3e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0240485  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2429  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.52 
 
 
388 aa  297  3e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0113  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.81 
 
 
394 aa  290  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2069  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.29 
 
 
388 aa  282  8.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2838  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.55 
 
 
389 aa  281  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1387  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.48 
 
 
374 aa  265  8.999999999999999e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4187  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.92 
 
 
395 aa  235  9e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.14 
 
 
395 aa  229  5e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.13 
 
 
390 aa  229  7e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4251  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.07 
 
 
394 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1009  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.97 
 
 
395 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3859  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.97 
 
 
395 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.46 
 
 
396 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4026  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.97 
 
 
395 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4228  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.72 
 
 
395 aa  227  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.323305  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4339  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.97 
 
 
395 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4141  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.97 
 
 
395 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.97 
 
 
395 aa  226  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3949  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.19 
 
 
395 aa  226  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0086  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.29 
 
 
368 aa  222  8e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.79 
 
 
391 aa  206  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.88 
 
 
399 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0031  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.75 
 
 
395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0680  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.57 
 
 
385 aa  200  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.78 
 
 
396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.95 
 
 
397 aa  197  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1662  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.2 
 
 
391 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0027  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.54 
 
 
388 aa  196  7e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.87483 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.16 
 
 
391 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2093  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.57 
 
 
391 aa  193  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3561  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.92 
 
 
397 aa  193  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0270592 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.82 
 
 
390 aa  193  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2856  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.63 
 
 
390 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  32 
 
 
395 aa  189  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3602  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.9 
 
 
398 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0613  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.17 
 
 
393 aa  189  1e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3534  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.66 
 
 
398 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.76 
 
 
388 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1051  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.99 
 
 
398 aa  187  4e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.307967  normal  0.238477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0718  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.14 
 
 
382 aa  186  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0631  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.57 
 
 
384 aa  186  7e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00112054  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0243  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.24 
 
 
389 aa  186  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0419  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.24 
 
 
389 aa  186  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014037 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.04 
 
 
397 aa  186  9e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3452  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.66 
 
 
397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427892  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2822  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.63 
 
 
382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0142  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.83 
 
 
407 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0560736 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16701  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  32.62 
 
 
379 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.601431  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00743  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.42 
 
 
384 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0830  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.42 
 
 
384 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2866  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.16 
 
 
384 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000062905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2867  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.42 
 
 
384 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00148387  normal  0.0589709 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00760  hypothetical protein  33.42 
 
 
384 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00012618  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0352  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.93 
 
 
393 aa  180  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  30.22 
 
 
395 aa  180  4.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.81 
 
 
394 aa  180  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0924  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.16 
 
 
384 aa  179  8e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00304993  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.91 
 
 
389 aa  179  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.07 
 
 
389 aa  179  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.99 
 
 
390 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16581  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  33.16 
 
 
379 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.0043161  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0247  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.37 
 
 
392 aa  178  2e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16481  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  33.33 
 
 
381 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1570  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.76 
 
 
501 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.537635  normal  0.306191 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0839  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.16 
 
 
384 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000113881  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.32 
 
 
391 aa  177  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0495  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.42 
 
 
396 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003870  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.98 
 
 
383 aa  176  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.697906  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0423  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.33 
 
 
384 aa  176  9e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0799  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.16 
 
 
384 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000322202  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2576  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.91 
 
 
384 aa  175  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828217  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1126  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.58 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1561  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  32.89 
 
 
379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.158607  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1393  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.29 
 
 
387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0360461  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.83 
 
 
384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2538  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.04 
 
 
384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00272507  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  31.92 
 
 
395 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01808  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.27 
 
 
383 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.67 
 
 
396 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0484  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.09 
 
 
399 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2595  putative 7-keto-8-aminopelargonic acid synthetase  31.4 
 
 
382 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.855243  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0890  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.98 
 
 
385 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.866629  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.71 
 
 
385 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.123721  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0922  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.71 
 
 
385 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0533  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.09 
 
 
396 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.801462  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2777  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.11 
 
 
388 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.773541  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0424  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.57 
 
 
381 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369907  normal  0.0974656 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.24 
 
 
385 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000743948  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2441  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.43 
 
 
382 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0723004  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0950  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.35 
 
 
367 aa  170  4e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0819  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.08 
 
 
374 aa  170  4e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.11779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>