More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2370 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2370  aminotransferase, class I and II  100 
 
 
409 aa  844    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0234318  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2130  8-amino-7-oxononanoate synthase  61.74 
 
 
410 aa  519  1e-146  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.452189 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2454  aminotransferase, class I and II  63.03 
 
 
410 aa  513  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.658148  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1195  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.84 
 
 
382 aa  323  4e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.760383 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2457  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.32 
 
 
399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0079  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.14 
 
 
394 aa  297  2e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2189  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.89 
 
 
388 aa  292  6e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1659  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.75 
 
 
380 aa  287  2e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0113  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.01 
 
 
394 aa  286  5.999999999999999e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2069  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.75 
 
 
388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0351  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.5 
 
 
380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0240485  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0328  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.5 
 
 
380 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.971003  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2838  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.88 
 
 
389 aa  282  9e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2429  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.4 
 
 
388 aa  279  8e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1387  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.87 
 
 
374 aa  261  1e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.54 
 
 
395 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4187  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.14 
 
 
395 aa  243  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4251  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.47 
 
 
394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4141  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.14 
 
 
395 aa  243  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4026  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.14 
 
 
395 aa  243  6e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4339  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.14 
 
 
395 aa  243  6e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3859  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.9 
 
 
395 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1009  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.47 
 
 
395 aa  239  5e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4228  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.84 
 
 
395 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.323305  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.31 
 
 
395 aa  238  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3949  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.63 
 
 
395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.07 
 
 
390 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  37 
 
 
396 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0031  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.34 
 
 
395 aa  217  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0086  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.33 
 
 
368 aa  209  6e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.41 
 
 
399 aa  206  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0680  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.58 
 
 
385 aa  205  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.11 
 
 
391 aa  203  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0142  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.32 
 
 
407 aa  196  5.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0560736 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1051  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.62 
 
 
398 aa  195  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.307967  normal  0.238477 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.31 
 
 
396 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2856  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.81 
 
 
390 aa  193  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.98 
 
 
397 aa  192  9e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3561  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.06 
 
 
397 aa  192  9e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0270592 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1662  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.61 
 
 
391 aa  188  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.68 
 
 
391 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3534  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.48 
 
 
398 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0631  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.29 
 
 
384 aa  186  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00112054  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.2 
 
 
397 aa  186  6e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3602  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.73 
 
 
398 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0495  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.66 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0027  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.85 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.87483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.6 
 
 
389 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.33 
 
 
389 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0886  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.68 
 
 
370 aa  181  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16481  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  33.42 
 
 
381 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1126  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.84 
 
 
387 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.56 
 
 
392 aa  180  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.01 
 
 
394 aa  180  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16701  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  34.08 
 
 
379 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.601431  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.75 
 
 
388 aa  179  8e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0819  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.49 
 
 
374 aa  179  9e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.11779 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1561  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  34.07 
 
 
379 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.158607  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  31.79 
 
 
395 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0613  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.26 
 
 
393 aa  178  1e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.31 
 
 
390 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.12 
 
 
391 aa  178  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2441  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.84 
 
 
382 aa  179  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0723004  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  34 
 
 
384 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2595  putative 7-keto-8-aminopelargonic acid synthetase  30.69 
 
 
382 aa  178  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.855243  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.41 
 
 
396 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3452  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.22 
 
 
397 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427892  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2998  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.69 
 
 
369 aa  177  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0168149  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0243  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.7 
 
 
389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0419  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.7 
 
 
389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5561  8-amino-7-oxononanoate synthase  36 
 
 
395 aa  173  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1393  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.5 
 
 
387 aa  173  3.9999999999999995e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0360461  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0424  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.24 
 
 
381 aa  173  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369907  normal  0.0974656 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.31 
 
 
390 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16581  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  32.9 
 
 
379 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.0043161  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2777  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.27 
 
 
388 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.773541  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.55 
 
 
385 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000743948  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1166  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.07 
 
 
386 aa  172  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.609374  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.55 
 
 
385 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.123721  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0922  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.55 
 
 
385 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0890  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.55 
 
 
385 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.866629  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0945  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.29 
 
 
385 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0094418  normal  0.966825 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.42 
 
 
390 aa  171  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0039  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.95 
 
 
395 aa  171  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  30.15 
 
 
395 aa  170  4e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1570  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.97 
 
 
501 aa  170  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.537635  normal  0.306191 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0423  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.75 
 
 
384 aa  170  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1470  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.54 
 
 
402 aa  170  5e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.000728084  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0317  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.3 
 
 
385 aa  170  5e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3712  aminotransferase, class I and II  32.19 
 
 
385 aa  169  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.040259  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003870  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.49 
 
 
383 aa  169  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.697906  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2093  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.85 
 
 
391 aa  169  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2822  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.91 
 
 
382 aa  169  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0002  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.91 
 
 
370 aa  169  9e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  30.08 
 
 
396 aa  168  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0718  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.06 
 
 
382 aa  168  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2048  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.68 
 
 
379 aa  168  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0352  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.52 
 
 
393 aa  168  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.62 
 
 
401 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0363  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.05 
 
 
390 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>