32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0874 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0874  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  329  7.000000000000001e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00470179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4581  hypothetical protein  45.65 
 
 		 196 aa  124  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0006  hypothetical protein  39.42 
 
 		 204 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001840  hypothetical protein  35.65 
 
 		 115 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2854  hypothetical protein  35.51 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1714  hypothetical protein  34.91 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0456721  hitchhiker  0.000000514861 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2749  hypothetical protein  34.91 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188485  normal  0.0271892 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2670  hypothetical protein  34.91 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2635  hypothetical protein  34.91 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.895876  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1580  hypothetical protein  34.26 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.530554  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1519  hypothetical protein  33.33 
 
 		 199 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000380714  normal  0.0491707 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1699  hypothetical protein  34.65 
 
 		 193 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1586  hypothetical protein  33.33 
 
 		 199 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.196957  normal  0.0760005 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1526  hypothetical protein  34.29 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2367  hypothetical protein  33.64 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.406853  normal  0.0535079 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1755  hypothetical protein  29.82 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.196459  normal  0.218269 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2832  hypothetical protein  27.19 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830995 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0385  hypothetical protein  31.82 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632262 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4515  putative cell wall-associated hydrolase  28.7 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104706  normal  0.503963 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4383  hypothetical protein  28.7 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4214  hypothetical protein  31.53 
 
 		 228 aa  47.4  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.285244  normal  0.47016 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1046  NC domain-containing protein  28.97 
 
 		 240 aa  46.2  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0134514  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1798  retinol acyltransferase domain-containing protein  29.29 
 
 		 240 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540939 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1770  retinol acyltransferase domain-containing protein  30.11 
 
 		 240 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1447  retinol acyltransferase domain-containing protein  29.29 
 
 		 240 aa  44.3  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1819  hypothetical protein  27.27 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1693  retinol acyltransferase domain-containing protein  28.28 
 
 		 240 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.36742  normal  0.0247076 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3516  retinol acyltransferase domain-containing protein  28.28 
 
 		 240 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2528  hypothetical protein  30.93 
 
 		 228 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00651  hypothetical protein  26.67 
 
 		 226 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0479  hypothetical protein  28.57 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5872  hypothetical protein  27.27 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>