27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0758 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0758  hypothetical protein  100 
 
 
423 aa  868    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0760  hypothetical protein  87.76 
 
 
425 aa  765    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  0.0853528 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0082  hypothetical protein  66.9 
 
 
426 aa  551  1e-155  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3879  hypothetical protein  43.24 
 
 
378 aa  296  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.280809  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0660  hypothetical protein  43.24 
 
 
378 aa  296  4e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.230623  normal  0.188322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3791  hypothetical protein  43.24 
 
 
378 aa  296  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0432048  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3692  hypothetical protein  44.15 
 
 
380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.020193  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1348  hypothetical protein  41.41 
 
 
380 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.549294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0803  hypothetical protein  42.04 
 
 
377 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0935  hypothetical protein  42.04 
 
 
377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0278  hypothetical protein  41.51 
 
 
375 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.241751  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0901  hypothetical protein  37.43 
 
 
386 aa  196  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4659  hypothetical protein  31.65 
 
 
384 aa  187  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.502748  normal  0.783273 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1003  hypothetical protein  34.44 
 
 
372 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5092  hypothetical protein  24.88 
 
 
448 aa  123  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1268  hypothetical protein  26.22 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5098  hypothetical protein  24.18 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.332072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0142  hypothetical protein  25.12 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0341  hypothetical protein  26.15 
 
 
458 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0580  hypothetical protein  24.72 
 
 
441 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.658008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3188  hypothetical protein  27.71 
 
 
467 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000405976  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4762  hypothetical protein  29.27 
 
 
430 aa  95.9  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3306  hypothetical protein  27.71 
 
 
460 aa  84.7  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0364673  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1063  hypothetical protein  35.33 
 
 
452 aa  73.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3012  hypothetical protein  33.16 
 
 
454 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000534501  hitchhiker  0.000212154 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3669  hypothetical protein  30.43 
 
 
516 aa  56.6  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33910  phosphoribosyl transferase family protein  33.96 
 
 
530 aa  48.9  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>