29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0600 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0600  hypothetical protein  100 
 
 		 56 aa  110  5e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.811202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1249  biopolymer transport protein ExbD/TolR  85.45 
 
 		 133 aa  98.6  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.368012 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1512  biopolymer transport protein ExbD/TolR  65.45 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1662  iopolymer transport protein ExbD/TolR  62.5 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00365164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1904  biopolymer transport protein ExbD/TolR  58.93 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.358326  normal  0.205106 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0997  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.9 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  41.07 
 
 		 157 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  39.29 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  39.29 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  41.07 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  41.07 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  41.07 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3720  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4482  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.14 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.728082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.96 
 
 		 138 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  35.29 
 
 		 140 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3313  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.758523 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0383  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.59 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0787741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04990  TolR-like protein  37.74 
 
 		 147 aa  41.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0118688  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.93 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3739  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.14 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.220249 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4694  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.96 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0620  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.14 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0672  TonB system transport protein ExbD  39.22 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678508  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1947  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.62 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2733  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.14 
 
 		 153 aa  40  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.14 
 
 		 143 aa  40  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>