More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1970 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1970  PhoH family protein  100 
 
 
379 aa  773    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0372063  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0627  putative PhoH-like protein, ATPase  73.57 
 
 
361 aa  543  1e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.121399  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0591  PhoH-like protein  72.7 
 
 
361 aa  540  9.999999999999999e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4787  PhoH family protein  58.28 
 
 
332 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4663  PhoH family protein  59.45 
 
 
332 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0633  PhoH family protein  60.06 
 
 
332 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4841  PhoH family protein  59.45 
 
 
332 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09060  PhoH-like protein  59.82 
 
 
336 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706372  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2910  PhoH family protein  55.87 
 
 
348 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4805  PhoH-like protein  59.02 
 
 
340 aa  378  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4951  PhoH-like protein  58.24 
 
 
334 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  58.18 
 
 
340 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  58.18 
 
 
340 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4346  PhoH-like protein  59.2 
 
 
340 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3780  PhoH family protein  59.38 
 
 
350 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.150452 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3301  lipoate synthase  56.75 
 
 
364 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2739  PhoH family protein  53.22 
 
 
328 aa  361  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3573  phoH family protein  55.42 
 
 
368 aa  357  2.9999999999999997e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189544  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0712  PhoH family protein  51.67 
 
 
347 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0238  PhoH-like protein  52.66 
 
 
330 aa  355  8.999999999999999e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1186  PhoH family protein  52.69 
 
 
348 aa  350  3e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0119675 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0728  PhoH family protein  53.28 
 
 
348 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.93581 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0823  PhoH family protein  53.28 
 
 
348 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0787  PhoH family protein  53.28 
 
 
348 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0775  PhoH family protein  53.28 
 
 
348 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.774508  normal  0.946623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0714  PhoH family protein  53.28 
 
 
348 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0457534  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1458  PhoH family protein  52.49 
 
 
341 aa  347  2e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0814  PhoH-like protein  49.73 
 
 
365 aa  347  2e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0395  PhoH family protein  51.03 
 
 
343 aa  347  2e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0587  PhoH family protein  52.59 
 
 
346 aa  345  6e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.139571  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00628  predicted protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  52.32 
 
 
359 aa  345  7e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2966  PhoH family protein  52.32 
 
 
359 aa  345  7e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.069683  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2985  PhoH family protein  52.32 
 
 
359 aa  345  7e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.189197  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0707  PhoH family protein  52.32 
 
 
346 aa  345  7e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0340161  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0682  PhoH family protein  52.32 
 
 
346 aa  345  7e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0121436  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0753  PhoH family protein  52.32 
 
 
346 aa  345  7e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00493548  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0689  PhoH family protein  52.32 
 
 
346 aa  345  7e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018585  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00619  hypothetical protein  52.32 
 
 
359 aa  345  7e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01229  hypothetical protein  53.14 
 
 
365 aa  345  8e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0995  PhoH-like protein  51.21 
 
 
356 aa  344  1e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0457768  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004212  phosphate starvation-inducible protein PhoH  50 
 
 
365 aa  343  2e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00393498  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0534  PhoH family protein  51.04 
 
 
342 aa  343  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02231  putative ATP-binding protein in pho regulon  52.23 
 
 
370 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.719746  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2335  PhoH-like protein  55.93 
 
 
364 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0892  PhoH family protein  50.44 
 
 
359 aa  343  4e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.427486  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1218  PhoH family protein  51.35 
 
 
351 aa  343  4e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0284374  normal  0.476314 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1183  PhoH family protein  51.57 
 
 
337 aa  343  4e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1007  PhoH family protein  51.67 
 
 
354 aa  342  9e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.109119  normal  0.0769537 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2949  PhoH family protein  51.6 
 
 
350 aa  341  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0483  phoH family protein  52.57 
 
 
367 aa  341  1e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000530716  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1107  PhoH family protein  50.66 
 
 
351 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1105  PhoH family protein  51.39 
 
 
348 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000125149 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3304  PhoH family protein  51.99 
 
 
348 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3440  PhoH family protein  51.99 
 
 
341 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3262  PhoH family protein  51.99 
 
 
341 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2856  PhoH family protein  50.7 
 
 
349 aa  339  5e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1180  PhoH family protein  51.39 
 
 
355 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3135  PhoH family protein  50.8 
 
 
352 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1003  PhoH family protein  51.69 
 
 
354 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00802061  normal  0.173492 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2721  PhoH family protein  52.65 
 
 
352 aa  338  7e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2357  PhoH family protein  52.65 
 
 
352 aa  338  7e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0225  PhoH family protein  52.65 
 
 
352 aa  338  7e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2924  PhoH family protein  49.72 
 
 
347 aa  338  7e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0071554 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3006  PhoH family protein  50.82 
 
 
357 aa  338  7e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.425195  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2916  PhoH family protein  50.82 
 
 
357 aa  338  7e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0010821  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1830  hypothetical protein  50.82 
 
 
357 aa  338  7e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1068  PhoH family protein  51.69 
 
 
347 aa  338  7e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00161934  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2437  PhoH family protein  52.65 
 
 
352 aa  338  7e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1196  PhoH family protein  50.8 
 
 
352 aa  338  8e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0597  PhoH-like protein  50 
 
 
340 aa  338  9e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0888  PhoH family protein  52.65 
 
 
354 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.437404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0709  PhoH family protein  52.65 
 
 
354 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95861  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3330  PhoH family protein  49.45 
 
 
357 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.128023 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0723  PhoH family protein  52.65 
 
 
354 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0749  PhoH family protein  50 
 
 
327 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019197 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2576  PhoH family protein  51.7 
 
 
356 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1495  PhoH-like protein  50.44 
 
 
323 aa  337  1.9999999999999998e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0629  putative PhoH-family protein  50.14 
 
 
359 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0682  PhoH family protein  50.15 
 
 
323 aa  335  7e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3239  putative phoH-like protein  52 
 
 
338 aa  335  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6022  PhoH-like protein  52.19 
 
 
348 aa  334  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611976  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0422  PhoH family protein  52.4 
 
 
330 aa  335  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0590  PhoH family protein  51.6 
 
 
358 aa  334  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.178371  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2082  PhoH-like protein  51.76 
 
 
348 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0604  PhoH family protein  51.6 
 
 
348 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2694  PhoH family protein  51.76 
 
 
348 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2722  PhoH family protein  51.76 
 
 
348 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.72441  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0411  PhoH family protein  48.22 
 
 
362 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.234067 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2611  PhoH family protein  51.6 
 
 
348 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126253  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3138  PhoH family protein  50.59 
 
 
346 aa  332  5e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.504008  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3697  PhoH family protein  51.74 
 
 
347 aa  332  9e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.104563  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2207  PhoH-like protein  49.47 
 
 
345 aa  332  9e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.935668  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0513  PhoH-like protein  49.85 
 
 
341 aa  331  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2747  PhoH family protein  51.31 
 
 
348 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3950  PhoH family protein  51.69 
 
 
374 aa  331  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.493956 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1883  PhoH family protein  49.58 
 
 
327 aa  330  3e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114064  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1948  ATP binding protein  49.3 
 
 
327 aa  329  5.0000000000000004e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.875532  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0407  PhoH family protein  51.8 
 
 
330 aa  328  9e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0474  PhoH-like protein  49.29 
 
 
322 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00447  ATP-binding protein  49.27 
 
 
328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000644199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>