More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1806 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1806  protein kinase  100 
 
 
345 aa  711    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.161714  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1539  putative protein kinase:Serine/threonine protein kinase  36.02 
 
 
330 aa  177  3e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.806427  normal  0.094009 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1718  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78764  normal  0.811225 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0019  serine/threonine protein kinase  28.97 
 
 
556 aa  87  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  25.81 
 
 
1032 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  27.06 
 
 
1018 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0026  serine/threonine protein kinase  27.85 
 
 
444 aa  82.8  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1133  serine/threonine protein kinase  26.7 
 
 
650 aa  82.8  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0031  kinase domain protein  26.81 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  25.35 
 
 
1032 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1202  serine/threonine protein kinase  26.39 
 
 
695 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0753061  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.05 
 
 
707 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3486  serine/threonine protein kinase  26.34 
 
 
989 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00873447  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1074  serine/threonine protein kinase  26.22 
 
 
653 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770535  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3883  serine/threonine protein kinase  26.75 
 
 
344 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  29.69 
 
 
641 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0171  serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 
575 aa  77  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.495174 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2221  serine/threonine protein kinase  28.86 
 
 
297 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26980  serine/threonine protein kinase  26.57 
 
 
538 aa  77  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  29.52 
 
 
690 aa  76.6  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00190  serine/threonine protein kinase  31.78 
 
 
663 aa  75.5  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  26.82 
 
 
666 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4064  protein kinase  26.39 
 
 
863 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.731546  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3039  serine/threonine protein kinase  26.99 
 
 
735 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2968  serine/threonine protein kinase  24.89 
 
 
741 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.37162  normal  0.344885 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  27.18 
 
 
667 aa  73.9  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  23.92 
 
 
646 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  32.05 
 
 
710 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1382  serine/threonine protein kinase  24.79 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1078  serine/threonine protein kinase  24.11 
 
 
419 aa  73.2  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110576  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2434  Serine/threonine protein kinase-like  26.2 
 
 
896 aa  72.8  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0164734  normal  0.121518 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  26.92 
 
 
951 aa  73.2  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4975  serine/threonine protein kinase  26.24 
 
 
580 aa  73.2  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0027  serine/threonine protein kinase  30.95 
 
 
473 aa  72.8  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.5 
 
 
681 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6656  serine/threonine protein kinase  27.46 
 
 
979 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.38837  normal  0.794447 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  25.55 
 
 
623 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2232  serine/threonine protein kinase  26.75 
 
 
1085 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235062  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.9 
 
 
658 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2155  serine/threonine protein kinase  27.31 
 
 
783 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1282  serine/threonine protein kinase  25.64 
 
 
517 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0542753  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  28.66 
 
 
582 aa  71.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  27.49 
 
 
617 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.56 
 
 
598 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3166  serine/threonine protein kinase  26.94 
 
 
606 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2753  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.61 
 
 
517 aa  70.5  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3956  serine/threonine protein kinase  31.21 
 
 
613 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3182  protein kinase  28.38 
 
 
494 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0356849  normal  0.234738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.24 
 
 
602 aa  70.1  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0201  serine/threonine protein kinase  25.23 
 
 
729 aa  70.1  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  28.37 
 
 
618 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  26.59 
 
 
559 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12123  transmembrane serine/threonine-protein kinase J pknJ  28.74 
 
 
589 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0224799  normal  0.854648 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3707  protein kinase  29.47 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  28.12 
 
 
626 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  27.37 
 
 
596 aa  69.3  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  26.89 
 
 
623 aa  69.3  0.00000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2112  protein kinase  29.12 
 
 
477 aa  69.3  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  27.42 
 
 
636 aa  68.6  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2915  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  30.57 
 
 
533 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0709852  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  27.69 
 
 
569 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2255  serine/threonine protein kinase  29.67 
 
 
450 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  27.65 
 
 
666 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8314  putative serine/threonine protein kinase  29.94 
 
 
554 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16067  predicted protein  26.45 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0854835  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6472  serine/threonine protein kinase  27.83 
 
 
497 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0240846 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  27.41 
 
 
1078 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.34 
 
 
607 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1111  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.78 
 
 
741 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621151  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  28.85 
 
 
612 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  25.24 
 
 
642 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  28.66 
 
 
615 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  26.38 
 
 
664 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  26.38 
 
 
664 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30 
 
 
700 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4435  serine/threonine protein kinase  29.23 
 
 
542 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  24.08 
 
 
668 aa  67  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  33.09 
 
 
1415 aa  67.4  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3624  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
552 aa  67  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401978  decreased coverage  0.000211559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4621  adenylate/guanylate cyclase  24.38 
 
 
687 aa  67  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.828122 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0699  serine/threonine protein kinase  26.37 
 
 
866 aa  67  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2796  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
982 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0264511  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.79 
 
 
613 aa  66.6  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0290  serine/threonine protein kinase  24.32 
 
 
453 aa  66.2  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  25.37 
 
 
651 aa  66.2  0.0000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4392  serine/threonine protein kinase  27.95 
 
 
891 aa  66.2  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0335  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.07 
 
 
476 aa  66.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102064  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3040  serine/threonine protein kinase  26.91 
 
 
368 aa  65.9  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  29.35 
 
 
586 aa  66.2  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.03 
 
 
594 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.88 
 
 
681 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.35 
 
 
1036 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3623  serine/threonine protein kinase  26.24 
 
 
715 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.569481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  28.04 
 
 
618 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4496  protein kinase  26.92 
 
 
488 aa  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.41 
 
 
645 aa  65.9  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1158  serine/threonine protein kinase  25.33 
 
 
647 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.429913  normal  0.143954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  28.85 
 
 
855 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.17 
 
 
520 aa  65.9  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1202  serine/threonine protein kinase  25.22 
 
 
655 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>