34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1653 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1653  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 341 aa  705    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1330  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  69.09 
 
 		 341 aa  476  1e-133  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000015519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1043  endonuclease/exonuclease/phosphatase  68.79 
 
 		 341 aa  474  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000546658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.01 
 
 		 346 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3785  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.05 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5372  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.69 
 
 		 352 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18295 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5248  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.38 
 
 		 353 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284119  normal  0.61528 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3781  hypothetical protein  27.84 
 
 		 381 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1438  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.22 
 
 		 374 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0801  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.3 
 
 		 355 aa  97.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.940089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.27 
 
 		 379 aa  94  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0690  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.16 
 
 		 357 aa  92.4  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0327295  normal  0.622853 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1020  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.8 
 
 		 358 aa  86.7  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05956  hypothetical protein  26.04 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1007  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.7 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.65557 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3245  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.83 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0973  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.39 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000220  hypothetical protein  26.38 
 
 		 317 aa  79  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1148  hypothetical protein  25.61 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0969  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.7 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2966  hypothetical protein  25.33 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1331  hypothetical protein  22.77 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3704  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.11 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3519  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.6 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.546474  normal  0.80442 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2933  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.48 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3298  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.8 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1059  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.97 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000904617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.65 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1308  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  24.9 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0818  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.26 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.823594  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0085  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.92 
 
 		 598 aa  51.6  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1073  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.71 
 
 		 597 aa  46.2  0.0008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15630  predicted extracellular nuclease  28.65 
 
 		 802 aa  43.9  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.35443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  25.34 
 
 		 795 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>