More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2321 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2516  Aldehyde Dehydrogenase  58.81 
 
 		 541 aa  677    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45780  Aldehyde dehydrogenase  84.28 
 
 		 459 aa  671    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0818  aldehyde dehydrogenase family protein  60.75 
 
 		 541 aa  647    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1289  Aldehyde Dehydrogenase  57.76 
 
 		 541 aa  663    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.657181 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4059  aldehyde dehydrogenase  58.02 
 
 		 542 aa  661    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.739878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1033  aldehyde dehydrogenase  62.99 
 
 		 541 aa  712    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3443  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, putative  99.26 
 
 		 539 aa  1096    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.381863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2271  Aldehyde Dehydrogenase  58.13 
 
 		 541 aa  669    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0315969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2321  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 539 aa  1105    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27210  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  84.49 
 
 		 541 aa  936    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2926  aldehyde dehydrogenase  94.43 
 
 		 539 aa  1048    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.131845 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2492  aldehyde dehydrogenase  82.09 
 
 		 541 aa  922    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149114  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0798  Aldehyde Dehydrogenase  55.6 
 
 		 540 aa  636    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2515  Aldehyde Dehydrogenase  60.48 
 
 		 539 aa  693    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2693  aldehyde dehydrogenase  58.02 
 
 		 542 aa  658    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0789  aldehyde dehydrogenase  63.18 
 
 		 541 aa  704    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3408  aldehyde dehydrogenase  58.4 
 
 		 542 aa  661    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.828845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1707  Aldehyde Dehydrogenase_  60.67 
 
 		 539 aa  692    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.595433  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5161  aldehyde dehydrogenase  58.4 
 
 		 569 aa  658    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.664596 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2144  aldehyde dehydrogenase  59.37 
 
 		 546 aa  676    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.676411  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1087  aldehyde dehydrogenase  62.48 
 
 		 540 aa  685    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.155396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2936  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  85.79 
 
 		 541 aa  916    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0301  gyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  57.88 
 
 		 545 aa  676    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22040  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  83.08 
 
 		 534 aa  919    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2493  aldehyde dehydrogenase  97.59 
 
 		 539 aa  1081    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.442503 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5240  aldehyde dehydrogenase  58.4 
 
 		 542 aa  661    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34600  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  86.17 
 
 		 541 aa  922    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.204448 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49950  Aldehyde dehydrogenase  84.11 
 
 		 541 aa  931    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.489954  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3462  aldehyde dehydrogenase  58.02 
 
 		 542 aa  661    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2859  aldehyde dehydrogenase  57.38 
 
 		 540 aa  634  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.209898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0162  aldehyde dehydrogenase  55.64 
 
 		 536 aa  632  1e-180  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.396114  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2068  aldehyde dehydrogenase  55.22 
 
 		 542 aa  622  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.72096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4869  aldehyde dehydrogenase  55.81 
 
 		 526 aa  620  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0146679  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1780  Aldehyde Dehydrogenase  55.87 
 
 		 560 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.760997 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1385  Aldehyde Dehydrogenase  54.94 
 
 		 524 aa  607  9.999999999999999e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.354292  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54378  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  43.44 
 
 		 588 aa  414  1e-114  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  30.55 
 
 		 477 aa  237  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4434  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.94 
 
 		 479 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000799989  normal  0.104038 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  31.71 
 
 		 479 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  33.56 
 
 		 457 aa  234  3e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0944  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.71 
 
 		 479 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0585208 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0750  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  31.71 
 
 		 479 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00148765  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.71 
 
 		 479 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.71 
 
 		 479 aa  233  5e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0756  aldehyde dehydrogenase  30.85 
 
 		 479 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000284676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0808  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.71 
 
 		 479 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000282988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0849  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.71 
 
 		 479 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.48 
 
 		 479 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  32.69 
 
 		 466 aa  231  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  31.34 
 
 		 479 aa  227  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  30.95 
 
 		 482 aa  221  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0823  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.73 
 
 		 475 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00319051  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0461  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  30.25 
 
 		 471 aa  217  5e-55  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0371  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  30.79 
 
 		 475 aa  215  9.999999999999999e-55  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  30.25 
 
 		 482 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1098  Aldehyde Dehydrogenase  31.22 
 
 		 476 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl259  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  31.22 
 
 		 472 aa  200  5e-50  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000056428  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12614  predicted protein  31.42 
 
 		 482 aa  198  3e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.410099  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1241  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  29.86 
 
 		 477 aa  194  3e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  33.41 
 
 		 533 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  27.59 
 
 		 499 aa  170  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0060  succinate semialdehyde dehydrogenase  29.29 
 
 		 507 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.455704  hitchhiker  0.00355427 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  30.02 
 
 		 499 aa  167  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  28.92 
 
 		 505 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2361  aldehyde dehydrogenase  30.94 
 
 		 683 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.536746  normal  0.202698 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000636  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  30.28 
 
 		 506 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  28.85 
 
 		 477 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.44 
 
 		 480 aa  163  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  26.89 
 
 		 498 aa  163  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2080  aldehyde dehydrogenase family protein  30.08 
 
 		 479 aa  162  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.710123  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0686  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  28.26 
 
 		 497 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000335425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  31.71 
 
 		 485 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  30.33 
 
 		 503 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01600  putative aldehyde dehydrogenase  27.86 
 
 		 497 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.510904  normal  0.728588 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01370  aldehyde dehydrogenase A, NAD-linked  28.3 
 
 		 479 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1596  aldehyde dehydrogenase A  28.3 
 
 		 479 aa  160  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01382  hypothetical protein  28.3 
 
 		 479 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  29.39 
 
 		 482 aa  160  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2021  aldehyde dehydrogenase A  28.3 
 
 		 479 aa  160  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0206  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  27.86 
 
 		 497 aa  160  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515725  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1498  aldehyde dehydrogenase A  28.54 
 
 		 479 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2243  aldehyde dehydrogenase A  28.54 
 
 		 479 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  31.63 
 
 		 461 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2230  Aldehyde Dehydrogenase  28.06 
 
 		 479 aa  159  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0354043  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3859  aldehyde dehydrogenase  28.57 
 
 		 501 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1454  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  28.73 
 
 		 480 aa  159  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278673  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2892  Aldehyde Dehydrogenase  29.95 
 
 		 461 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1319  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  26.58 
 
 		 489 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2222  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  28.87 
 
 		 489 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0132587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  29.18 
 
 		 482 aa  158  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1757  aldehyde dehydrogenase A  28.06 
 
 		 479 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000249904 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  32.4 
 
 		 480 aa  157  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  29.31 
 
 		 455 aa  157  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1309  aldehyde dehydrogenase  27.88 
 
 		 477 aa  157  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.472659  normal  0.0179284 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1119  aldehyde dehydrogenase  27.25 
 
 		 478 aa  157  5.0000000000000005e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.193972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  28.79 
 
 		 484 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3822  Aldehyde Dehydrogenase  26.97 
 
 		 518 aa  157  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.959646  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0679  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  27.74 
 
 		 497 aa  157  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000513111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  27.38 
 
 		 502 aa  156  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  31.33 
 
 		 481 aa  156  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>