14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2246 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2246  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2399  hypothetical protein  88.78 
 
 		 294 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480883 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28830  hypothetical protein  54.55 
 
 		 310 aa  299  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0152098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3582  hypothetical protein  43.97 
 
 		 289 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42680  hypothetical protein  43.53 
 
 		 289 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  26.96 
 
 		 664 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0275  hypothetical protein  30.57 
 
 		 502 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  33.08 
 
 		 350 aa  49.7  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3457  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  31.62 
 
 		 335 aa  49.3  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0967146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1635  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.5 
 
 		 545 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.97 
 
 		 526 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.222131 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  32.14 
 
 		 357 aa  43.5  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  32.14 
 
 		 352 aa  43.1  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38790  Peroxiredoxin  28.95 
 
 		 644 aa  42.4  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.605672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>