45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4419 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4419  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  100 
 
 		 92 aa  191  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.395785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0770  PemI-like protein  91.67 
 
 		 84 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0889  SpoVT/AbrB-like  63.1 
 
 		 84 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5699  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  55.42 
 
 		 83 aa  99.4  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.815302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3377  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  53.01 
 
 		 83 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00170089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5741  antitoxin ChpS  36.9 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4793  antitoxin ChpS  36.9 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3769  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.9 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4477  antitoxin ChpS  36.9 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4702  antitoxin ChpS  35.71 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4011  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.33 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3504  plasmid stable inheritance protein I  37.04 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3899  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.9 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.957207  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01481  suppressor of inhibitory function of ChpB  33.33 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2865  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.33 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.191423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3090  antitoxin MazE  28.05 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000278445  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0929  antitoxin MazE  28.05 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000171018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2921  antitoxin MazE  28.05 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000204371  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0905  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  28.05 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000171203  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4043  antitoxin MazE  28.05 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000354584  normal  0.435382 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5125  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.57 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.105676 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02590  hypothetical protein  28.05 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000450519  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2927  antitoxin MazE  28.05 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299538  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3087  antitoxin MazE  28.05 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000511414  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02628  antitoxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system  28.05 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000289943  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4225  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  30.86 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3251  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.18 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.79659 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1108  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.9 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3062  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40.68 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4870  transcriptional regulator/antitoxin MazE  31.88 
 
 		 80 aa  50.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.672249  hitchhiker  0.00000150934 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1098  pemI family protein  32.94 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0248006  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2540  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.12 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9912  plasmid stable inheritance protein I  29.63 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1200  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.48 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3308  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40.68 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1229  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.48 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4160  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.59 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.429167 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0073  ChpR family protein  29.41 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.261005  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1020  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  28.41 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000368524  unclonable  0.00000000295771 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2066  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.9 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0165  stable plasmid inheritance protein PemI  27.5 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000183667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1877  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40.43 
 
 		 83 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0786  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.31 
 
 		 92 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0412184 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0203  DNA polymerase beta subunit  48.65 
 
 		 155 aa  41.6  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1936  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.58 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>