22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3504 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3504  plasmid stable inheritance protein I  100 
 
 		 85 aa  171  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5125  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  65.88 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.105676 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0165  stable plasmid inheritance protein PemI  57.83 
 
 		 85 aa  106  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000183667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3599  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  59.77 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4011  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  45.88 
 
 		 83 aa  89.4  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01481  suppressor of inhibitory function of ChpB  40.51 
 
 		 85 aa  67  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9912  plasmid stable inheritance protein I  38.82 
 
 		 87 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4419  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.04 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.395785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0770  PemI-like protein  35.8 
 
 		 84 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5741  antitoxin ChpS  36.25 
 
 		 85 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4793  antitoxin ChpS  36.25 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4477  antitoxin ChpS  36.25 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3769  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.25 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4702  antitoxin ChpS  32.91 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5699  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.71 
 
 		 83 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.815302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3377  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.44 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00170089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0786  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.05 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0412184 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4870  transcriptional regulator/antitoxin MazE  35.71 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.672249  hitchhiker  0.00000150934 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1108  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.25 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2865  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.75 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.191423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4160  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40.38 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.429167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3899  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  38.89 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.957207  normal  0.173268 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>