40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3377 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3377  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  100 
 
 
83 aa  168  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00170089  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5699  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  87.95 
 
 
83 aa  154  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.815302  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0770  PemI-like protein  54.22 
 
 
84 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4419  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  53.01 
 
 
92 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.395785  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0889  SpoVT/AbrB-like  45.78 
 
 
84 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3769  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  39.76 
 
 
83 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4793  antitoxin ChpS  39.76 
 
 
83 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4477  antitoxin ChpS  39.76 
 
 
83 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4702  antitoxin ChpS  39.76 
 
 
83 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5741  antitoxin ChpS  38.55 
 
 
85 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4011  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.5 
 
 
83 aa  57.4  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01481  suppressor of inhibitory function of ChpB  36.9 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2865  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.29 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.191423  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4870  transcriptional regulator/antitoxin MazE  36.9 
 
 
80 aa  53.9  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.672249  hitchhiker  0.00000150934 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1229  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.5 
 
 
80 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3504  plasmid stable inheritance protein I  35.44 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1098  pemI family protein  36.9 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0248006  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1200  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.5 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1020  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  30.95 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000368524  unclonable  0.00000000295771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3899  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.52 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.957207  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9912  plasmid stable inheritance protein I  32.5 
 
 
87 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3251  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.36 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.79659 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4160  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.12 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.429167 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3062  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.9 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4623  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.8 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.683129 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2540  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.09 
 
 
79 aa  42.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2489  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40.68 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4043  antitoxin MazE  28.4 
 
 
82 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000354584  normal  0.435382 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3090  antitoxin MazE  28.4 
 
 
82 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000278445  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2921  antitoxin MazE  28.4 
 
 
82 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000204371  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0929  antitoxin MazE  28.4 
 
 
82 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000171018  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3087  antitoxin MazE  28.4 
 
 
82 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000511414  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2927  antitoxin MazE  28.4 
 
 
82 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299538  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02590  hypothetical protein  28.4 
 
 
82 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000450519  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4225  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  46.51 
 
 
86 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0905  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  28.4 
 
 
82 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000171203  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02628  antitoxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system  28.4 
 
 
82 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000289943  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1108  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  31.33 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0694  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.33 
 
 
81 aa  40.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5125  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  30.38 
 
 
85 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.105676 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>