19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2865 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2865  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  100 
 
 		 88 aa  182  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.191423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5741  antitoxin ChpS  36.05 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4702  antitoxin ChpS  34.52 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3377  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.29 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00170089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0770  PemI-like protein  33.33 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0889  SpoVT/AbrB-like  32.14 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4477  antitoxin ChpS  34.52 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4793  antitoxin ChpS  34.52 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3769  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.52 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4419  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.33 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.395785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5699  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.71 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.815302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5125  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  38.75 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.105676 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4011  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.62 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0165  stable plasmid inheritance protein PemI  35 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000183667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01481  suppressor of inhibitory function of ChpB  32.56 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3504  plasmid stable inheritance protein I  33.75 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0694  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  31.67 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3062  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.79 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0693  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 343 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.571595  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>