48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0693 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0693  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 
343 aa  694    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.571595  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2335  phosphate uptake regulator, PhoU  77.84 
 
 
343 aa  538  9.999999999999999e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1386  phosphate uptake regulator, PhoU  76.97 
 
 
343 aa  535  1e-151  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2336  phosphate uptake regulator, PhoU  75.58 
 
 
344 aa  521  1e-147  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.119502  normal  0.953358 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0312  phosphate uptake regulator, PhoU  67.84 
 
 
344 aa  467  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1604  phosphate uptake regulator, PhoU  27.11 
 
 
348 aa  124  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2476  phosphate uptake regulator, PhoU  28.1 
 
 
331 aa  106  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1329  phosphate uptake regulator, PhoU  28.37 
 
 
351 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.445187  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1794  phosphate uptake regulator, PhoU  28.61 
 
 
332 aa  104  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0479748 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1545  phosphate uptake regulator, PhoU  31.62 
 
 
332 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1622  SpoVT/AbrB domain-containing protein  27.17 
 
 
349 aa  102  8e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00903094  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3440  phosphate uptake regulator, PhoU  28.65 
 
 
331 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0914  phosphate uptake regulator, PhoU  27.54 
 
 
334 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0495  phosphate uptake regulator, PhoU  28.21 
 
 
331 aa  99.8  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2356  phosphate uptake regulator, PhoU  26.84 
 
 
334 aa  97.4  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0620  phosphate uptake regulator, PhoU  26.64 
 
 
336 aa  91.3  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2400  phosphate uptake regulator, PhoU  28.57 
 
 
344 aa  91.7  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.282043 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1682  phosphate uptake regulator, PhoU  26.92 
 
 
336 aa  91.3  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1765  hypothetical protein  24.27 
 
 
336 aa  90.5  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1119  hypothetical protein  26.52 
 
 
333 aa  86.7  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.588146  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  25.35 
 
 
326 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0358933 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0595  phosphate uptake regulator, PhoU  26.17 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1659  SpoVT/AbrB domain-containing protein  27.08 
 
 
326 aa  83.2  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.724868  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1904  SpoVT/AbrB domain protein  29.9 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.365247  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0479  phosphate uptake regulator, PhoU  26.41 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2363  phosphate uptake regulator, PhoU  27.07 
 
 
344 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.486275  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1968  phosphate uptake regulator, PhoU  21.43 
 
 
336 aa  78.2  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1425  phosphate uptake regulator, PhoU  24.44 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1069  phosphate uptake regulator, PhoU  23.19 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1065  phosphate uptake regulator, PhoU  27.35 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0353  phosphate uptake regulator, PhoU  24.56 
 
 
350 aa  67  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0896452  normal  0.250975 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1015  phosphate uptake regulator, PhoU  27.35 
 
 
297 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.313422 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1600  phosphate uptake regulator, PhoU  28.17 
 
 
299 aa  64.7  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0897  phosphate uptake regulator, PhoU  22.59 
 
 
331 aa  65.1  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.247428  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3128  hypothetical protein  22.81 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0447  phosphate uptake regulator, PhoU  19.19 
 
 
349 aa  62.8  0.000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000672536  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1287  phosphate uptake regulator, PhoU  27.42 
 
 
297 aa  62.8  0.000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2081  phosphate uptake regulator, PhoU  24.9 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0893566 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1831  phosphate uptake regulator, PhoU  28.88 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000208314 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1926  phosphate uptake regulator, PhoU  21.97 
 
 
330 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.820933  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1393  phosphate uptake regulator, PhoU  20.77 
 
 
335 aa  59.7  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3556  SpoVT/AbrB domain protein  24.84 
 
 
339 aa  59.3  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1597  SpoVT/AbrB domain protein  23.85 
 
 
327 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.755665  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0944  phosphate uptake regulator, PhoU  21.07 
 
 
337 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0860  phosphate uptake regulator, PhoU  21.61 
 
 
339 aa  54.7  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.198015 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2950  putative regulatory protein  21.93 
 
 
293 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11037  normal  0.0119157 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0430  SpoVT/AbrB domain protein  20.22 
 
 
315 aa  46.2  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1109  SpoVT/AbrB domain-containing protein  22.05 
 
 
331 aa  45.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.235676  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>