22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0889 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0889  SpoVT/AbrB-like  100 
 
 		 84 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0770  PemI-like protein  64.29 
 
 		 84 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4419  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  63.1 
 
 		 92 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.395785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5699  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  49.4 
 
 		 83 aa  84.3  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.815302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3377  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  45.78 
 
 		 83 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00170089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5741  antitoxin ChpS  33.33 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3769  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.33 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4477  antitoxin ChpS  33.33 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4793  antitoxin ChpS  33.33 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2865  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.14 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.191423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4702  antitoxin ChpS  32.14 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4011  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  31.33 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4225  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.73 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3062  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.79 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01481  suppressor of inhibitory function of ChpB  29.89 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2540  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  30.95 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0579  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.59 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3610  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.36 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.429024  normal  0.027299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1200  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.21 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1229  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  30.86 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9912  plasmid stable inheritance protein I  29.63 
 
 		 87 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3899  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.29 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.957207  normal  0.173268 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>