18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9912 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_9912  plasmid stable inheritance protein I  100 
 
 		 87 aa  174  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0786  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  46.15 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0412184 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3504  plasmid stable inheritance protein I  38.82 
 
 		 85 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5125  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.65 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.105676 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0165  stable plasmid inheritance protein PemI  32.53 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000183667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4011  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.33 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0770  PemI-like protein  33.33 
 
 		 84 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01481  suppressor of inhibitory function of ChpB  34.15 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4419  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  29.63 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.395785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3377  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.5 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00170089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5741  antitoxin ChpS  32.5 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3599  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.48 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4477  antitoxin ChpS  32.5 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4793  antitoxin ChpS  32.5 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3769  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.5 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5699  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.5 
 
 		 83 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.815302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0889  SpoVT/AbrB-like  29.63 
 
 		 84 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4702  antitoxin ChpS  33.33 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>