20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5125 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5125  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  100 
 
 		 85 aa  174  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.105676 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3504  plasmid stable inheritance protein I  65.88 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3599  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  68.97 
 
 		 87 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0165  stable plasmid inheritance protein PemI  55.42 
 
 		 85 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000183667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4011  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  45.88 
 
 		 83 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4254  hypothetical protein  80 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0216195 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9912  plasmid stable inheritance protein I  37.65 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0770  PemI-like protein  34.57 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4419  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.57 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.395785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2865  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  38.75 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.191423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4160  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  38.6 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.429167 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01481  suppressor of inhibitory function of ChpB  30.12 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4870  transcriptional regulator/antitoxin MazE  33.33 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.672249  hitchhiker  0.00000150934 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5741  antitoxin ChpS  29.11 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4793  antitoxin ChpS  29.11 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4477  antitoxin ChpS  29.11 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3769  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  29.11 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5699  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  31.65 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.815302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4702  antitoxin ChpS  27.85 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3377  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  30.38 
 
 		 83 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00170089  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>