21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0579 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0579  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  100 
 
 		 96 aa  191  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3610  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  72.37 
 
 		 76 aa  116  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.429024  normal  0.027299 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4270  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  75 
 
 		 77 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0902743  normal  0.118236 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0985  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  65.79 
 
 		 77 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3056  hypothetical protein  59.21 
 
 		 77 aa  99.8  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2889  transcriptional regulator, AbrB family  60 
 
 		 77 aa  97.1  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0461439  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2509  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  60 
 
 		 77 aa  97.1  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3976  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  59.46 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00576537  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4391  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  59.46 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5964  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  58.11 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3974  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  52.63 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4024  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  51.32 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.738162  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7280  SpoVT/AbrB-like cell growth regulatory protein  50 
 
 		 75 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4160  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  42.86 
 
 		 80 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.429167 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0694  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.07 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0933  hypothetical protein  41.67 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0399505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4870  transcriptional regulator/antitoxin MazE  36.23 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.672249  hitchhiker  0.00000150934 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0889  SpoVT/AbrB-like  35.59 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0073  ChpR family protein  37.68 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.261005  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2489  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  44.68 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1020  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.19 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000368524  unclonable  0.00000000295771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>