24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4024 on replicon NC_009957
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009957  Dshi_4024  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  100 
 
 		 75 aa  146  9e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.738162  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7280  SpoVT/AbrB-like cell growth regulatory protein  78.67 
 
 		 75 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4270  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  61.84 
 
 		 77 aa  88.6  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0902743  normal  0.118236 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3610  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  53.95 
 
 		 76 aa  76.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.429024  normal  0.027299 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0985  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  48.68 
 
 		 77 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0579  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  51.32 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2889  transcriptional regulator, AbrB family  50 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0461439  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2509  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  50 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3976  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  54.67 
 
 		 77 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00576537  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4391  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  54.67 
 
 		 77 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5964  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  54.67 
 
 		 77 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3056  hypothetical protein  47.37 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3974  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  46.05 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4160  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  53.85 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.429167 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0694  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  41.27 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1020  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  48.84 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000368524  unclonable  0.00000000295771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1016  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  45.24 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.110199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4870  transcriptional regulator/antitoxin MazE  35.71 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.672249  hitchhiker  0.00000150934 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1229  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  41.3 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1200  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  41.3 
 
 		 80 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4623  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  48.84 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.683129 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3062  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  38.1 
 
 		 102 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2540  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  41.46 
 
 		 79 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2489  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  41.67 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>