46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2921 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0905  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  100 
 
 		 82 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000171203  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02590  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000450519  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4043  antitoxin MazE  100 
 
 		 82 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000354584  normal  0.435382 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3090  antitoxin MazE  100 
 
 		 82 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000278445  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2921  antitoxin MazE  100 
 
 		 82 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000204371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0929  antitoxin MazE  100 
 
 		 82 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000171018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3087  antitoxin MazE  100 
 
 		 82 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000511414  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2927  antitoxin MazE  100 
 
 		 82 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299538  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02628  antitoxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system  100 
 
 		 82 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000289943  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0073  ChpR family protein  43.75 
 
 		 81 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.261005  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1098  pemI family protein  46.05 
 
 		 79 aa  73.6  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0248006  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1108  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  41.25 
 
 		 80 aa  73.2  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3899  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  41.56 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.957207  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2066  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  47.56 
 
 		 82 aa  71.6  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3308  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40.51 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4160  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40.51 
 
 		 80 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.429167 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0264  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  44.3 
 
 		 80 aa  60.8  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3062  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.62 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1200  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.93 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0428  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.97 
 
 		 80 aa  57  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1229  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  31.71 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2540  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.49 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0770  PemI-like protein  30 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1016  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  38.55 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.110199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4419  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  28.05 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.395785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4870  transcriptional regulator/antitoxin MazE  31.17 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.672249  hitchhiker  0.00000150934 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4623  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.25 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.683129 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4225  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  30.59 
 
 		 86 aa  51.6  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1020  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  31.71 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000368524  unclonable  0.00000000295771 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2886  PemI family protein  33.77 
 
 		 83 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.503679  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2506  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.77 
 
 		 83 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0165  stable plasmid inheritance protein PemI  39.06 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000183667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01481  suppressor of inhibitory function of ChpB  31.82 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2489  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  42.86 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5741  antitoxin ChpS  32.93 
 
 		 85 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3251  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  26.58 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.79659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1478  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  30.77 
 
 		 85 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.749182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3769  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.93 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4702  antitoxin ChpS  32.93 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4793  antitoxin ChpS  32.93 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4477  antitoxin ChpS  32.93 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3610  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.94 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.429024  normal  0.027299 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5699  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  29.63 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.815302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3377  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  28.4 
 
 		 83 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00170089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1690  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  46.81 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.368646 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4011  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.2 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>