43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3308 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3308  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  100 
 
 		 80 aa  159  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0264  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  60 
 
 		 80 aa  99  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0428  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  47.5 
 
 		 80 aa  86.3  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4160  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  43.75 
 
 		 80 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.429167 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4870  transcriptional regulator/antitoxin MazE  41.25 
 
 		 80 aa  74.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.672249  hitchhiker  0.00000150934 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1108  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  39.24 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1020  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.5 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000368524  unclonable  0.00000000295771 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2540  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  43.04 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0905  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40.51 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000171203  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02590  hypothetical protein  40.51 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000450519  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4043  antitoxin MazE  40.51 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000354584  normal  0.435382 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3090  antitoxin MazE  40.51 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000278445  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2921  antitoxin MazE  40.51 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000204371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0929  antitoxin MazE  40.51 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000171018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3087  antitoxin MazE  40.51 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000511414  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02628  antitoxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system  40.51 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000289943  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2927  antitoxin MazE  40.51 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299538  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2489  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  45 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3899  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  38.16 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.957207  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3062  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  45.07 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0073  ChpR family protein  32.43 
 
 		 81 aa  57  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.261005  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2066  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.33 
 
 		 82 aa  52.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1098  pemI family protein  35.44 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0248006  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0770  PemI-like protein  42.37 
 
 		 84 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2886  PemI family protein  32.47 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.503679  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2506  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.47 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1478  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.89 
 
 		 85 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.749182  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1367  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  42.59 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1016  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  31.25 
 
 		 80 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.110199 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4623  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.62 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.683129 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5741  antitoxin ChpS  33.33 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1200  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  31.17 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4419  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40.68 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.395785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1229  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  29.87 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3769  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.33 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4793  antitoxin ChpS  33.33 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4477  antitoxin ChpS  33.33 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1936  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.23 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4702  antitoxin ChpS  33.33 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2584  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  30.26 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1690  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  39.22 
 
 		 63 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.368646 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01481  suppressor of inhibitory function of ChpB  29.23 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0694  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  45.65 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>