21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1367 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1367  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  100 
 
 
83 aa  169  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1478  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  63.41 
 
 
85 aa  104  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.749182  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2584  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  54.88 
 
 
85 aa  92.8  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2886  PemI family protein  60 
 
 
83 aa  90.1  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.503679  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2506  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  60 
 
 
83 aa  90.1  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01481  suppressor of inhibitory function of ChpB  37.14 
 
 
85 aa  55.5  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3899  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  41.79 
 
 
87 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.957207  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1098  pemI family protein  40 
 
 
79 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0248006  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1108  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  43.86 
 
 
80 aa  51.2  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2066  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  44.07 
 
 
82 aa  50.4  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0073  ChpR family protein  41.82 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.261005  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3308  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  42.59 
 
 
80 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4870  transcriptional regulator/antitoxin MazE  32.89 
 
 
80 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.672249  hitchhiker  0.00000150934 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5741  antitoxin ChpS  35.59 
 
 
85 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0264  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  39.29 
 
 
80 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4793  antitoxin ChpS  35.59 
 
 
83 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4477  antitoxin ChpS  35.59 
 
 
83 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3769  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.59 
 
 
83 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2489  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.49 
 
 
89 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4702  antitoxin ChpS  35.59 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0428  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  31.48 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>