10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1936 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1936  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  100 
 
 		 88 aa  174  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3308  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.23 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0770  PemI-like protein  34.09 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5741  antitoxin ChpS  39.68 
 
 		 85 aa  42  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01481  suppressor of inhibitory function of ChpB  30.68 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3769  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  39.68 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4477  antitoxin ChpS  39.68 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4793  antitoxin ChpS  39.68 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4419  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.58 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.395785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4623  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.23 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.683129 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>