More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4279 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4279  Maf-like protein  100 
 
 
203 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  83.25 
 
 
203 aa  334  7e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0943  Maf-like protein  84.08 
 
 
202 aa  316  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.706065  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0976  Maf-like protein  83.74 
 
 
203 aa  313  8e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4160  Maf-like protein  72.02 
 
 
200 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0841  Maf-like protein  69.95 
 
 
198 aa  260  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52716  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4469  maf protein  73.06 
 
 
200 aa  251  6e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58110  Maf-like protein  67.01 
 
 
201 aa  248  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0859  Maf-like protein  67.69 
 
 
198 aa  244  6e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5092  Maf-like protein  70.1 
 
 
201 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12680  Maf-like protein  69.47 
 
 
196 aa  234  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  58.82 
 
 
200 aa  211  7.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  55.98 
 
 
201 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0186  maf protein  54.26 
 
 
192 aa  198  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  58.12 
 
 
200 aa  197  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3543  Maf-like protein  55.91 
 
 
197 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454216  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  55.91 
 
 
197 aa  195  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0266  Maf-like protein  54.59 
 
 
197 aa  194  6e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3279  Maf-like protein  55.38 
 
 
197 aa  194  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00231758  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03107  Maf-like protein  55.38 
 
 
197 aa  192  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0459  maf protein  55.38 
 
 
197 aa  192  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0394308  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0459  Maf-like protein  55.38 
 
 
197 aa  192  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00615525  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0401  Maf-like protein  54.59 
 
 
197 aa  192  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1195  Maf-like protein  54.59 
 
 
197 aa  192  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0118421  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03058  hypothetical protein  55.38 
 
 
197 aa  192  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00132702  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0468  Maf-like protein  54.59 
 
 
197 aa  192  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00621529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3437  Maf-like protein  55.38 
 
 
197 aa  192  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00398739  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4564  Maf-like protein  54.84 
 
 
197 aa  191  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  0.647968 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  54.3 
 
 
197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002386  septum formation protein Maf  53.3 
 
 
189 aa  188  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591917  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03682  Maf-like protein  51.65 
 
 
189 aa  186  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0470  maf protein  56.25 
 
 
194 aa  184  7e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0255  Maf-like protein  54.05 
 
 
197 aa  184  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0124527  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3823  maf protein  51.02 
 
 
206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.778182  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1940  maf protein  51.04 
 
 
202 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0271564  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0406  maf protein  55.73 
 
 
196 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1507  maf protein  49.18 
 
 
192 aa  179  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3189  putative inhibitor of septum formation  54.69 
 
 
210 aa  179  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3674  maf protein  52.97 
 
 
197 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1125  maf protein  52.2 
 
 
192 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3563  Maf-like protein  53.23 
 
 
197 aa  177  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3634  Maf-like protein  53.23 
 
 
197 aa  177  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.0041574 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3562  Maf-like protein  53.23 
 
 
197 aa  177  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.036153  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3669  Maf-like protein  53.23 
 
 
197 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68747  normal  0.628888 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0486  Maf-like protein  49.46 
 
 
191 aa  177  8e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00884241  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4557  septum formation protein Maf  50 
 
 
212 aa  176  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0408  maf protein  53.44 
 
 
202 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.490696  normal  0.258397 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4408  Maf-like protein  51.35 
 
 
194 aa  176  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000616092  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0363  maf protein  53.2 
 
 
207 aa  176  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3731  Maf-like protein  53.23 
 
 
197 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  0.0857351 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0378  maf protein  52.72 
 
 
202 aa  174  9e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2138  maf protein  52.66 
 
 
193 aa  174  9e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0561  maf protein  53.12 
 
 
198 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.429106  normal  0.272101 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2658  Maf-like protein  52.97 
 
 
196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0546169  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3331  maf protein  52.15 
 
 
198 aa  169  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3735  maf protein  53.76 
 
 
195 aa  168  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2837  Maf-like protein  52.43 
 
 
205 aa  167  7e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00477693  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0172  Maf-like protein  47.96 
 
 
201 aa  167  8e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3751  maf protein  49.74 
 
 
198 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2550  maf protein  45.26 
 
 
191 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1737  maf protein  50 
 
 
207 aa  164  8e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00267  septum formation protein Maf  43.08 
 
 
196 aa  161  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4399  maf protein  47.98 
 
 
205 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0577  maf protein  52.04 
 
 
198 aa  161  6e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0344402  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2113  maf protein  49.21 
 
 
199 aa  161  6e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1366  maf protein  53.19 
 
 
205 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.518192  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2566  maf protein  52.63 
 
 
195 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2953  maf protein  52.63 
 
 
195 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0469  Maf-like protein  51.34 
 
 
199 aa  159  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2125  maf protein  51.35 
 
 
198 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0385886 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3832  maf protein  50.81 
 
 
197 aa  158  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0290532  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3645  maf protein  51.04 
 
 
194 aa  157  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0408  Maf-like protein  51.35 
 
 
189 aa  157  9e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0462  Maf-like protein  47.31 
 
 
199 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2217  Maf-like protein  52.36 
 
 
210 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2901  maf protein  48.02 
 
 
202 aa  156  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1688  Maf-like protein  52.36 
 
 
210 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2300  Maf-like protein  52.36 
 
 
210 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2323  Maf-like protein  51.83 
 
 
210 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.768418 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3353  maf protein  51.12 
 
 
198 aa  155  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000252643  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4095  maf protein  50 
 
 
194 aa  155  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0525  maf protein  50.51 
 
 
200 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.422258  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3819  maf protein  50 
 
 
200 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.449035  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2338  Maf-like protein  51.83 
 
 
228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299073  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0500  maf protein  51.52 
 
 
200 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00570929  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0521  maf protein  51.52 
 
 
200 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114774  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3469  maf protein  51.04 
 
 
194 aa  155  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.141262  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0482  maf protein  50.52 
 
 
194 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.556215 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5627  Maf-like protein  52.41 
 
 
210 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0535  maf protein  46.73 
 
 
194 aa  151  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.997587 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3266  Maf-like protein  48.69 
 
 
209 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1295  Maf-like protein  48.69 
 
 
209 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308196  normal  0.077241 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0978  Maf-like protein  51.34 
 
 
210 aa  149  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.246189  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3255  Maf-like protein  46.7 
 
 
194 aa  149  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.487755  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0527  maf protein  52.6 
 
 
199 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0831909  normal  0.0651324 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2394  Maf-like protein  48.47 
 
 
207 aa  148  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366012  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0983  maf protein  48.11 
 
 
194 aa  147  7e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1734  Maf-like protein  46.39 
 
 
200 aa  147  9e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  48.74 
 
 
194 aa  147  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1791  maf protein  51.34 
 
 
213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.868606  normal  0.765103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>