More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5393 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5393  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 148 aa  310  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.650664  hitchhiker  0.00916992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5344  acetyltransferase  93.92 
 
 		 148 aa  293  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  93.24 
 
 		 148 aa  291  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5635  GCN5-related N-acetyltransferase  76.35 
 
 		 148 aa  248  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013842  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5119  GCN5-related N-acetyltransferase  77.03 
 
 		 148 aa  243  8e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000288207  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5506  acetyltransferase, GNAT family  73.65 
 
 		 148 aa  238  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5058  GCN5-related N-acetyltransferase  72.97 
 
 		 148 aa  229  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6220  putative acetyltransferase  56.46 
 
 		 149 aa  190  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71690  GNAT family acetyltransferase  56.46 
 
 		 149 aa  189  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0137  GCN5-related N-acetyltransferase  56.16 
 
 		 147 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1141  GCN5-related N-acetyltransferase  56.46 
 
 		 149 aa  183  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2785  GCN5-related N-acetyltransferase  58.22 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0132  GCN5-related N-acetyltransferase  57.34 
 
 		 146 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2964  GCN5-related N-acetyltransferase  52.74 
 
 		 147 aa  167  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2497  GCN5-related N-acetyltransferase  51.39 
 
 		 147 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12144  normal  0.087022 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  47.95 
 
 		 402 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2165  GCN5-related N-acetyltransferase  51.7 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0161004  normal  0.0731596 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5176  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  49.32 
 
 		 335 aa  159  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.472651 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4135  GCN5-related N-acetyltransferase  51.35 
 
 		 399 aa  156  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0441895  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1954  GCN5-related N-acetyltransferase  49.66 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0219812  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7075  GCN5-related N-acetyltransferase  49.01 
 
 		 153 aa  153  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0194  GCN5-related N-acetyltransferase  46.36 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5785  GCN5-related N-acetyltransferase  50.68 
 
 		 400 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3849  GCN5-related N-acetyltransferase  50.68 
 
 		 414 aa  150  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156281  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3951  GCN5-related N-acetyltransferase  49.32 
 
 		 413 aa  150  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4519  GCN5-related N-acetyltransferase  50.68 
 
 		 414 aa  150  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3262  GCN5-related N-acetyltransferase  48.63 
 
 		 148 aa  150  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1329  GCN5-related N-acetyltransferase  51.03 
 
 		 414 aa  150  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4414  GCN5-related N-acetyltransferase  49.32 
 
 		 413 aa  150  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0279389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0310  GCN5-related N-acetyltransferase  46.58 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2044  GCN5-related N-acetyltransferase  47.97 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.624808  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0193  putative acetyltransferase  47.68 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3266  GCN5-related N-acetyltransferase  47.02 
 
 		 158 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  48.65 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.771243  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1190  GCN5-related N-acetyltransferase  46.62 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.806576 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4113  GCN5-related N-acetyltransferase  46.36 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2652  putative acetyltransferase  47.62 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1310  GCN5-related N-acetyltransferase  47.62 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1796  putative histone acetyltransferase (HAT)  46.26 
 
 		 148 aa  144  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5125  GCN5-related N-acetyltransferase  47.02 
 
 		 158 aa  143  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4647  GCN5-related N-acetyltransferase  46.26 
 
 		 155 aa  143  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20803  normal  0.0229692 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4515  GCN5-related N-acetyltransferase  46.26 
 
 		 155 aa  143  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3851  GCN5-related N-acetyltransferase  44.9 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.619468  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0836  GCN5-related N-acetyltransferase  43.15 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4438  GCN5-related N-acetyltransferase  46.36 
 
 		 153 aa  137  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09990  putative acetyltransferase  44.52 
 
 		 152 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0175715  normal  0.714198 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2917  GCN5-related N-acetyltransferase  45.03 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4251  Histone acetyl transferase protein  47.3 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60277  N-acetyltransferase HPA3  42.38 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.751079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  39.73 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1882  putative acetyltransferase  44.9 
 
 		 152 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0785639  normal  0.209526 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3664  GCN5-related N-acetyltransferase  36.99 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671996  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1012  GCN5-related N-acetyltransferase  38.78 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3002  GCN5-related N-acetyltransferase  39.04 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533457  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3514  GCN5-related N-acetyltransferase  37.67 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0990  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 		 152 aa  123  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  38.36 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.643013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3351  GCN5-related N-acetyltransferase  38.36 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3469  GCN5-related N-acetyltransferase  41.22 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.293029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0274  GCN5-related N-acetyltransferase  41.26 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4542  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.3744 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2683  GCN5-related N-acetyltransferase  40.41 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.454456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3138  GCN5-related N-acetyltransferase  40.14 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2987  acetyltransferase  39.29 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.82546  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2598  GCN5-related N-acetyltransferase  37.76 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1633  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.499665  normal  0.357486 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2018  GCN5-related N-acetyltransferase  35.17 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406329  normal  0.262902 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1866  GCN5-related N-acetyltransferase  39.86 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.990958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6192  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 		 144 aa  114  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2912  GCN5-related N-acetyltransferase  38.73 
 
 		 145 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.196361 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4277  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.701884 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0028  GCN5-related N-acetyltransferase  41.13 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.578829 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0311  GCN5-related N-acetyltransferase  36.3 
 
 		 148 aa  107  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126839  normal  0.150201 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1820  GCN5-related N-acetyltransferase  36.11 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.209618  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0549  GCN5-related N-acetyltransferase  35.62 
 
 		 146 aa  100  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2583  GCN5-related N-acetyltransferase  39.58 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0675931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2017  GCN5-related N-acetyltransferase  30.14 
 
 		 146 aa  97.4  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059884  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3458  GCN5-related N-acetyltransferase  32.64 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.229516  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2356  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2432  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2540  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777279 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1461  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3406  acetyltransferase  37.63 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.344947 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2838  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2444  acetyltransferase, GNAT family  30.63 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2450  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2565  putative acetyltransferase protein  29.41 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4130  GCN5-related N-acetyltransferase  29.37 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2822  GCN5-related N-acetyltransferase  33.58 
 
 		 169 aa  67.4  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06250  GNAT family acetyltransferase  31.18 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129837  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0584  putative N-acetyltransferase  31.18 
 
 		 158 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  27.21 
 
 		 159 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02661  putative N-acetyltransferase  24.64 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.967011  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0312  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.648752  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1584  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1393  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.232677  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4651  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.217746 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0886  acetyltransferase  30.11 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3724  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1241  GCN5-related N-acetyltransferase  28.78 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.595226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>