70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3938 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3938  flagellar protein FlaG protein  100 
 
 		 118 aa  231  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.754994  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4377  flagellin FlaG, putative  53.78 
 
 		 114 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3702  flagellar protein FlaG protein  50.43 
 
 		 117 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1528  flagellar protein FlaG protein  49.14 
 
 		 119 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1950  flagellin FlaG, putative  48.41 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375217  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1490  flagellar protein FlaG protein  42.86 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3465  flagellar protein FlaG protein  44.44 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.557575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2834  flagellar protein FlaG protein  60.81 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.211869  hitchhiker  0.00811626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4278  hypothetical protein  61.64 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50280  hypothetical protein  57.33 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  decreased coverage  0.0000840961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3015  flagellin FlaG, putative  37.17 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0702  flagellar protein FlaG protein  43.56 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.239709 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0463  flagellar protein FlaG protein  37.4 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2366  flagellar protein FlaG protein  40 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0701  flagellar protein FlaG protein  45.78 
 
 		 129 aa  67  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.292415 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1334  flagellar protein FlaG protein  38.68 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.427646  normal  0.0470122 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2591  flagellar protein FlaG protein  42.25 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3084  flagellar protein FlaG protein  35.79 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3236  flagellin FlaG  35.51 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2199  bacitracin resistance protein BacA  42.42 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0783  flagellar protein FlaG protein  41.56 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536835 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1610  flagellar protein FlaG protein  40.54 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2305  uncharacterized flagellar protein FlaG  52.73 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1491  flagellin FlaG  39.29 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1358  flagellar protein FlaG protein  41.67 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1316  flagellar protein FlaG protein  43.66 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1499  flagellar protein FlaG protein  45.1 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2944  flagellar protein FlaG protein  42.19 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3076  flagellar protein FlaG protein  42.19 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0409729  normal  0.440687 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0505  flagellar protein FlaG protein  38.89 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.86441  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2584  flagellar protein FlaG protein  42.19 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2888  flagellar protein FlaG protein  40.85 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5253  flagellar protein FlaG  31.46 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0373226 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1429  flagellar protein FlaG protein  40.62 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1449  flagellar protein FlaG protein  42.42 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.797561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1980  flagellar protein FlaG protein  41.54 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2934  flagellar protein FlaG protein  39.06 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1473  flagellin FlaG, putative  37.68 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1985  flagellar protein FlaG protein  32.98 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5090  flagellar protein FlaG protein  39.44 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1353  flagellar protein FlaG protein  36.25 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417115  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1174  flagellar protein FlaG protein  47.27 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000565064  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3074  flagellar protein FlaG protein  45.45 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002807  flagellin protein FlaG  32.22 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1274  flagellar protein FlaG protein  38.81 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0104  flagellar protein FlaG protein  30.77 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1342  flagellar protein FlaG protein  32.93 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0401  flagellar protein FlaG protein  43.14 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1692  flagellar protein FlaG protein  28.57 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03170  flagellar protein FlaG  31.11 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1782  flagellar protein FlaG protein  31.82 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.815538  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1622  flagellar protein FlaG protein  29.55 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0311  flagellar protein FlaG protein  25.32 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1338  flagellar protein FlaG protein  38.46 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0764  flagellar protein FlaG protein  32.14 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1591  putative flagellar protein FlaG  34.57 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0779  flagellar protein FlaG  30.77 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1725  flagellar protein FlaG  31.76 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1034  flagellar protein FlaG  32.05 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0854669  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3016  flagellar protein FlaG  29.55 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0083  flagellar protein FlaG protein  44.23 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27850  Flagellar protein  31.08 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0632  flagellar protein FlaG protein  31.94 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000438476 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1527  flagellar protein FlaG protein  27.43 
 
 		 124 aa  43.5  0.0009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00123965  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3202  flagellar protein FlaG  30.12 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2230  flagellar protein FlaG protein  31.43 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000232456 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2219  flagellar protein FlaG protein  26.47 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0093  flagellar protein FlaG  25 
 
 		 126 aa  41.2  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0871  flagellar protein FlaG protein  22.11 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1383  flagellar protein FlaG  29.58 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>