15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3657 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008607  Ppro_3657  YHS domain-containing protein  100 
 
 
213 aa  442  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2076  YHS domain protein  57.14 
 
 
224 aa  262  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000164593 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2144  YHS domain protein  56.19 
 
 
224 aa  256  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000462643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1543  YHS  56.87 
 
 
215 aa  252  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.258352 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  44.74 
 
 
804 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  43.75 
 
 
928 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  42 
 
 
846 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3775  ABC transporter related  34.25 
 
 
301 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0491  YHS domain-containing protein  48.72 
 
 
55 aa  45.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1212  cation transport ATPase  41.46 
 
 
902 aa  43.5  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2038  hypothetical protein  40 
 
 
301 aa  43.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0608424  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4564  permease  45.24 
 
 
441 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1856  heavy metal translocating P-type ATPase  39.47 
 
 
973 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121057  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5288  protein of unknown function DUF182  39.47 
 
 
372 aa  41.6  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  36.59 
 
 
801 aa  41.6  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>