15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2144 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2144  YHS domain protein  100 
 
 		 224 aa  462  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000462643  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2076  YHS domain protein  90.62 
 
 		 224 aa  421  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000164593 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3657  YHS domain-containing protein  56.19 
 
 		 213 aa  256  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1543  YHS  48.54 
 
 		 215 aa  210  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.258352 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  47.92 
 
 		 928 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6196  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  45.1 
 
 		 814 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7156  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 841 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.802165 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 818 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1856  heavy metal translocating P-type ATPase  47.22 
 
 		 973 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121057  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5288  protein of unknown function DUF182  45.95 
 
 		 372 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0231  hypothetical protein  46.34 
 
 		 299 aa  43.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  48.65 
 
 		 804 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1212  cation transport ATPase  45.95 
 
 		 902 aa  42.4  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 		 817 aa  41.6  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 		 817 aa  41.6  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>