11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1543 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1543  YHS  100 
 
 		 215 aa  447  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.258352 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3657  YHS domain-containing protein  56.87 
 
 		 213 aa  252  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2144  YHS domain protein  48.54 
 
 		 224 aa  210  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000462643  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2076  YHS domain protein  49.3 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000164593 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  44.19 
 
 		 804 aa  45.4  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4834  heavy metal translocating P-type ATPase  44.74 
 
 		 796 aa  42.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.311359  normal  0.100077 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  42.11 
 
 		 801 aa  42.4  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 793 aa  42.4  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3775  ABC transporter related  37.93 
 
 		 301 aa  42.4  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  35.85 
 
 		 928 aa  41.6  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5288  protein of unknown function DUF182  41.03 
 
 		 372 aa  41.6  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>