23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2319 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2319  hypothetical protein  100 
 
 
442 aa  884    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.722749  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2175  hypothetical protein  51.38 
 
 
437 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0020  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  49.32 
 
 
481 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120001  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2007  heat shock protein DnaJ domain protein  43.47 
 
 
441 aa  300  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8484999999999997e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2220  heat shock protein DnaJ domain protein  42.76 
 
 
441 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.300892  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0489  hypothetical protein  37.58 
 
 
452 aa  264  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2988  hypothetical protein  37.84 
 
 
456 aa  249  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874903  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6873  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.65 
 
 
248 aa  96.3  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  34.78 
 
 
507 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1137  serine/threonine protein kinase  28.89 
 
 
962 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  30.43 
 
 
503 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  33.66 
 
 
344 aa  53.5  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0822  heat shock protein DnaJ-like protein  43.9 
 
 
635 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.77208  normal  0.437006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0098  hypothetical protein  35.56 
 
 
276 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0307347 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  34.23 
 
 
474 aa  50.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0440  hypothetical protein  34.26 
 
 
391 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1223  hypothetical protein  34.26 
 
 
391 aa  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0372  hypothetical protein  34.26 
 
 
391 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0620  hypothetical protein  36 
 
 
219 aa  47  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  37.27 
 
 
1085 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01879  DnaJ domain protein  40.98 
 
 
371 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.052076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6624  hypothetical protein  29.46 
 
 
175 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  0.194539 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0912  DnaJ domain-containing protein  41.07 
 
 
373 aa  43.1  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>