More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2144 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2926  aldehyde dehydrogenase  58.81 
 
 
539 aa  672    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.131845 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0818  aldehyde dehydrogenase family protein  60.75 
 
 
541 aa  659    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3443  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, putative  59.37 
 
 
539 aa  675    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.381863  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5161  aldehyde dehydrogenase  57.09 
 
 
569 aa  658    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.664596 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2936  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  59.52 
 
 
541 aa  657    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2859  aldehyde dehydrogenase  56.61 
 
 
540 aa  648    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.209898  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1289  Aldehyde Dehydrogenase  54.92 
 
 
541 aa  648    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.657181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2516  Aldehyde Dehydrogenase  57.33 
 
 
541 aa  665    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2515  Aldehyde Dehydrogenase  76.81 
 
 
539 aa  872    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3408  aldehyde dehydrogenase  56.9 
 
 
542 aa  661    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.828845  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4059  aldehyde dehydrogenase  56.72 
 
 
542 aa  657    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.739878  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2321  aldehyde dehydrogenase  59.37 
 
 
539 aa  676    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2492  aldehyde dehydrogenase  56.24 
 
 
541 aa  651    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149114  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2693  aldehyde dehydrogenase  56.53 
 
 
542 aa  656    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0789  aldehyde dehydrogenase  65.12 
 
 
541 aa  743    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1033  aldehyde dehydrogenase  64.94 
 
 
541 aa  748    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2493  aldehyde dehydrogenase  59.55 
 
 
539 aa  682    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.442503 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22040  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  59.77 
 
 
534 aa  668    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2144  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
546 aa  1115    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.676411  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49950  Aldehyde dehydrogenase  59.63 
 
 
541 aa  664    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.489954  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1707  Aldehyde Dehydrogenase_  76.99 
 
 
539 aa  877    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.595433  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0798  Aldehyde Dehydrogenase  56.66 
 
 
540 aa  635    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0301  gyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  57.2 
 
 
545 aa  693    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27210  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  60 
 
 
541 aa  669    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5240  aldehyde dehydrogenase  56.9 
 
 
542 aa  661    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299168  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34600  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  59.52 
 
 
541 aa  657    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.204448 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3462  aldehyde dehydrogenase  56.72 
 
 
542 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2271  Aldehyde Dehydrogenase  56.64 
 
 
541 aa  654    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0315969 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1087  aldehyde dehydrogenase  61.61 
 
 
540 aa  704    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.155396  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1780  Aldehyde Dehydrogenase  56.22 
 
 
560 aa  626  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.760997 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0162  aldehyde dehydrogenase  54.51 
 
 
536 aa  616  1e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.396114  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2068  aldehyde dehydrogenase  54.12 
 
 
542 aa  609  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.72096  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1385  Aldehyde Dehydrogenase  52.94 
 
 
524 aa  587  1e-166  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.354292  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4869  aldehyde dehydrogenase  51.62 
 
 
526 aa  579  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0146679  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45780  Aldehyde dehydrogenase  59.48 
 
 
459 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54378  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  41.63 
 
 
588 aa  402  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.97 
 
 
482 aa  233  6e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  31.97 
 
 
482 aa  233  9e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  32.8 
 
 
466 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1098  Aldehyde Dehydrogenase  31.63 
 
 
476 aa  216  7e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  28.81 
 
 
477 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  29.59 
 
 
479 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0944  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  29.59 
 
 
479 aa  213  9e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0585208 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0808  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  29.59 
 
 
479 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000282988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0750  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  29.59 
 
 
479 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00148765  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0849  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  29.59 
 
 
479 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  28.27 
 
 
479 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  29.59 
 
 
479 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  29.59 
 
 
479 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4434  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  29.59 
 
 
479 aa  211  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000799989  normal  0.104038 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0756  aldehyde dehydrogenase  29.13 
 
 
479 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000284676  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0823  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  29.81 
 
 
475 aa  207  5e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00319051  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  28.45 
 
 
457 aa  206  6e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0461  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  29.98 
 
 
471 aa  206  7e-52  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  29.13 
 
 
479 aa  205  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0371  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  32.58 
 
 
475 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1241  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  30.9 
 
 
477 aa  192  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl259  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  29.16 
 
 
472 aa  188  2e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000056428  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  30.02 
 
 
499 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12614  predicted protein  30.12 
 
 
482 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.410099  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  28.28 
 
 
493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0073  aldehyde dehydrogenase  30.91 
 
 
468 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2680  succinate-semialdehyde dehydrogenase  31.21 
 
 
476 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1309  aldehyde dehydrogenase  29.17 
 
 
477 aa  174  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.472659  normal  0.0179284 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  30.37 
 
 
516 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1119  aldehyde dehydrogenase  27.23 
 
 
478 aa  172  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.193972  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1120  aldehyde dehydrogenase  31.21 
 
 
485 aa  172  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000801479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0735  Aldehyde Dehydrogenase  30.94 
 
 
490 aa  171  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0429832  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0509  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase (acylating)  28.16 
 
 
491 aa  170  6e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0997846  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  28.34 
 
 
493 aa  170  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  31.14 
 
 
461 aa  169  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1774  aldehyde dehydrogenase  27.06 
 
 
480 aa  169  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00658035  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1454  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  29.76 
 
 
480 aa  169  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  27.33 
 
 
498 aa  167  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01370  aldehyde dehydrogenase A, NAD-linked  27.87 
 
 
479 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1596  aldehyde dehydrogenase A  28.13 
 
 
479 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01382  hypothetical protein  27.87 
 
 
479 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  29.26 
 
 
476 aa  166  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  28.18 
 
 
496 aa  166  8e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0484  Aldehyde Dehydrogenase  27 
 
 
464 aa  166  8e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2230  Aldehyde Dehydrogenase  27.66 
 
 
479 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0354043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1108  aldehyde dehydrogenase family protein  28.6 
 
 
475 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00189493  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  29.65 
 
 
480 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0060  succinate semialdehyde dehydrogenase  27.96 
 
 
507 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.455704  hitchhiker  0.00355427 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0569  aldehyde dehydrogenase  32.66 
 
 
486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.710627  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1610  aldehyde dehydrogenase  32.66 
 
 
486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156903  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1663  aldehyde dehydrogenase  32.66 
 
 
486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.131134  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2021  aldehyde dehydrogenase A  27.66 
 
 
479 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0486  aldehyde dehydrogenase  32.66 
 
 
486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.577547  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1637  aldehyde dehydrogenase  32.66 
 
 
486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0759  nonphosphorylating glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  30.1 
 
 
484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0247006  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2239  aldehyde dehydrogenase  32.66 
 
 
486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0390454  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5624  aldehyde dehydrogenase  32.66 
 
 
486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0667  aldehyde dehydrogenase  32.66 
 
 
486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3337  Aldehyde Dehydrogenase  30.1 
 
 
487 aa  164  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6645  aldehyde dehydrogenase  28.51 
 
 
492 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  30.56 
 
 
480 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09770  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  28.57 
 
 
461 aa  164  4.0000000000000004e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00172669  normal  0.0203425 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3766  aldehyde dehydrogenase  29.89 
 
 
483 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1953  aldehyde dehydrogenase A  27.1 
 
 
479 aa  164  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>