53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0413 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0413  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 
238 aa  482  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1772  Ion transport 2 domain-containing protein  34.68 
 
 
211 aa  105  9e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1233  hypothetical protein  35.94 
 
 
227 aa  99  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0271776 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2231  Ion transport 2 domain protein  40.51 
 
 
234 aa  97.8  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338612 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0517  Ion transport 2 domain protein  31.86 
 
 
218 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000756398  decreased coverage  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0500  Ion transport 2 domain protein  32.24 
 
 
218 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  31.82 
 
 
271 aa  90.5  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1808  Ion transport 2 domain-containing protein  42.45 
 
 
228 aa  85.5  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0516361  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  39.2 
 
 
222 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  39.8 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2018  Ion transport 2 domain protein  39.81 
 
 
231 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1907  putative ion channel  38.6 
 
 
220 aa  78.2  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1842  Ion transport 2 domain-containing protein  33.83 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2482  Ion transport 2 domain protein  37.04 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.745368  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0647  ion transport family protein  39.6 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1459  Ion transport 2 domain-containing protein  34.56 
 
 
247 aa  75.1  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209929 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06642  Kef-type K+ transport system NAD-binding component  40 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001142  potassium channel protein  38.1 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3734  hypothetical protein  32.87 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.724435 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4778  hypothetical protein  31.9 
 
 
214 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248369  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1485  hypothetical protein  31.58 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0749  Ion transport 2 domain protein  40.59 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2859  Ion transport 2 domain protein  34.86 
 
 
219 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0255  ion transport 2 domain-containing protein  33.06 
 
 
226 aa  63.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.106172 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19221  hypothetical protein  32.82 
 
 
264 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.774034 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0923  hypothetical protein  31.82 
 
 
242 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.581577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54680  hypothetical protein  34 
 
 
102 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238288  hitchhiker  0.00000298461 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5186  putative Voltage-gated potassium channel  27.35 
 
 
229 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.240486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0760  Ion transport 2 domain protein  47.06 
 
 
224 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400355  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22810  hypothetical protein  25 
 
 
220 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1489  Ion transport 2 domain protein  27.05 
 
 
262 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670111  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  32.48 
 
 
252 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  39.22 
 
 
276 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  41.51 
 
 
509 aa  45.8  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1654  Ion transport 2 domain-containing protein  37.97 
 
 
235 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.773346  normal  0.437872 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0098  hypothetical protein  27.87 
 
 
131 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0496  Ion transport 2 domain protein  47.73 
 
 
134 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43813  VIC family transporter: potassium ion channel  33.93 
 
 
79 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  27.27 
 
 
275 aa  43.5  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18070  Ion channel  25.95 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00210304  normal  0.546721 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0540  putative potassium channel protein  46.94 
 
 
134 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4786  putative potassium channel protein  46.94 
 
 
134 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0423111  hitchhiker  0.0000753067 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0591  putative potassium channel protein  44 
 
 
134 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0599184  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0402  Ion transport, K+ channel  34.78 
 
 
113 aa  42.4  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.234978 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0590  potassium channel protein, putative  44.9 
 
 
134 aa  42  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0503  potassium channel protein  44.9 
 
 
134 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1362  Ion transport 2 domain protein  39.34 
 
 
134 aa  42  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0446  LCTB protein, potassium channel  44.9 
 
 
134 aa  42  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0442  LCTB protein, potassium channel  44.9 
 
 
134 aa  42  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0457  Ion transport 2 domain-containing protein  42.86 
 
 
133 aa  42  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0447878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0535  potassium channel protein  44.9 
 
 
134 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0211593  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0518  putative potassium channel protein  44.9 
 
 
134 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000436021 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  44.44 
 
 
405 aa  42  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>