21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0362 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0362  conserved hypothetical secreted protein  100 
 
 
278 aa  579  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.807375  normal  0.507937 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0361  hypothetical protein  83.76 
 
 
304 aa  487  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5379  hypothetical protein  43.03 
 
 
302 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1848  conserved hypothetical secreted protein  43.03 
 
 
302 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51214  hitchhiker  0.00000000124644 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3435  hypothetical protein  38.1 
 
 
321 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.425135  normal  0.326123 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0609  putative lipoprotein  36 
 
 
305 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.581249 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0904  hypothetical protein  26.92 
 
 
302 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000046277  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3459  hypothetical protein  26.92 
 
 
302 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000354114  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0920  hypothetical protein  25.61 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000510544  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0955  hypothetical protein  25.61 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000014544  normal  0.349997 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0919  hypothetical protein  25.61 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000244259  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2655  hypothetical protein  27.68 
 
 
298 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000824644  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0418  hypothetical protein  27.04 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000826848  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1798  hypothetical protein  25.93 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000750515  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0710  hypothetical protein  30.41 
 
 
315 aa  60.1  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.03339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2423  hypothetical protein  22.81 
 
 
339 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0961  hypothetical protein  23.53 
 
 
333 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0128  hypothetical protein  24.51 
 
 
300 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0854  hypothetical protein  22.75 
 
 
333 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3401  hypothetical protein  22.52 
 
 
335 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3095  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  21.96 
 
 
310 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0691949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>