14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3823 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3823  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  222  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.661206  normal  0.810845 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3450  hypothetical protein  51.11 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0951964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3779  hypothetical protein  49.06 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0458  cysteine-rich repeat-containing protein  31.09 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3800  hypothetical protein  44.62 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3542  hypothetical protein  34.44 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00522757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4937  hypothetical protein  38.1 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0968098  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2498  cysteine-rich repeat-containing protein  25.17 
 
 		 169 aa  45.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2012  hypothetical protein  35.06 
 
 		 240 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502792  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4276  hypothetical protein  36.51 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6286  hypothetical protein  42.86 
 
 		 245 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6950  hypothetical protein  25.78 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4213  hypothetical protein  37.68 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.742786 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0455  hypothetical protein  33.82 
 
 		 227 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>