21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1480 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1480  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 128 aa  233  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.934887  normal  0.224655 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.89 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.019614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4633  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.96 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.765233  hitchhiker  0.000000449148 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.23 
 
 		 439 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.75 
 
 		 450 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.892104 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 		 429 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2341  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.58 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1933  hypothetical protein  38.18 
 
 		 423 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497125  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3711  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.3 
 
 		 429 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.712619  normal  0.892725 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.94 
 
 		 430 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.04 
 
 		 435 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.71 
 
 		 440 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4817  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.71 
 
 		 440 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.71 
 
 		 440 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2076  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.48 
 
 		 442 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3852  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.4 
 
 		 430 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332822  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2437  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.35 
 
 		 431 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0181526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.23 
 
 		 417 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.682348 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.61 
 
 		 431 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 417 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.62 
 
 		 424 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0560564  normal  0.509097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>